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西郊林密无处去,北城雾沉晚风凉。

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Forwarded from Solidot
完整测序人类基因组

2021-06-05 21:02 #科学

当 20 年前人类基因组项目和 Celera Genomics 公司测序人类基因组时,他们没有完整测序。有 15% 的基因组因为技术限制研究人员无法弄明白某些 DNA 片段是如何组合在一起的。科学家之后解决了部分问题,但仍然有 8% 的基因组缺失。现在,Telomere-to-Telomere (T2T) 联盟的研究人员宣布 完成了对人类基因组完整测序研究报告发表在预印本网站 bioRxiv 上。研究人员报告发现了编码蛋白质的 115 个新基因,基因总数达到 19,969 个。来自 Pacific Biosciences 公司的新测序技术帮助研究人员完成了这一成就,新技术使用激光扫描从细胞里隔离的 DNA 长链,一次最高 2 万碱基对。
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某个 SIMD 友好的文件分块算法 http://www.stringology.org/event/2019/p08.html
草,刚看见作者底下写着
Toga Networks, a Huawei Company
4 Ha’Harash St, Hod Hasharon, Israel

WahWay 还搞这个?
&'a ::rynco::UntitledChannel
某个 SIMD 友好的文件分块算法 http://www.stringology.org/event/2019/p08.html
仔细读了一遍,这个算法确实有意思。

想要 SIMD 加速,于是拿连续的内存块放在同一个向量寄存器里面,然后对他们分别进行计算;但是这样会导致连续的内存被分配到了不同的数据块内,不能做到字节精度的分块。为了解决这个问题,他们又对向量寄存器进行同一条件的判断,连续 n 个 true 的后面就是切分点。

喵啊
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