KIF5C

KIF5C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1VFV, 1VFW, 1VFX, 1VFZ, 3J6H, 3WRD, 3X2T
Ідентифікатори
Символи	KIF5C, CDCBM2, KINN, NKHC, NKHC-2, NKHC2, kinesin family member 5C
Зовнішні ІД	OMIM: 604593 MGI: 1098269 HomoloGene: 56234 GeneCards: KIF5C
Пов'язані генетичні захворювання
complex cortical dysplasia with other brain malformations 2
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule motor activity • nucleotide binding • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • plus-end-directed microtubule motor activity • ATP binding • ATPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • Кінезин • ciliary rootlet • neuron projection • мікротрубочка • цитоскелет • дендрит (нейробіологія) • dendrite cytoplasm • cell projection • soma • axonal growth cone • синапс • distal axon • axon cytoplasm Біологічний процес • GO:0034613 protein localization • cytoskeleton-dependent intracellular transport • mRNA transport • organelle organization • axon guidance • microtubule-based movement • motor neuron axon guidance • synaptic vesicle transport • anterograde dendritic transport of neurotransmitter receptor complex • anterograde axonal protein transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3800	16574
Ensembl	ENSG00000168280 ENSG00000276734	ENSMUSG00000026764
UniProt	O60282	P28738
RefSeq (мРНК)	NM_004522	NM_008449
RefSeq (білок)	NP_004513	NP_032475
Локус (UCSC)	Хр. 2: 148.88 – 149.03 Mb	Хр. 2: 49.51 – 49.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KIF5C (англ. Kinesin family member 5C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 109 495.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADPAECSIK		VMCRFRPLNE		AEILRGDKFI		PKFKGDETVV		IGQGKPYVFD
RVLPPNTTQE		QVYNACAKQI		VKDVLEGYNG		TIFAYGQTSS		GKTHTMEGKL
HDPQLMGIIP		RIAHDIFDHI		YSMDENLEFH		IKVSYFEIYL		DKIRDLLDVS
KTNLAVHEDK		NRVPYVKGCT		ERFVSSPEEV		MDVIDEGKAN		RHVAVTNMNE
HSSRSHSIFL		INIKQENVET		EKKLSGKLYL		VDLAGSEKVS		KTGAEGAVLD
EAKNINKSLS		ALGNVISALA		EGTKTHVPYR		DSKMTRILQD		SLGGNCRTTI
VICCSPSVFN		EAETKSTLMF		GQRAKTIKNT		VSVNLELTAE		EWKKKYEKEK
EKNKTLKNVI		QHLEMELNRW		RNGEAVPEDE		QISAKDQKNL		EPCDNTPIID
NIAPVVAGIS		TEEKEKYDEE		ISSLYRQLDD		KDDEINQQSQ		LAEKLKQQML
DQDELLASTR		RDYEKIQEEL		TRLQIENEAA		KDEVKEVLQA		LEELAVNYDQ
KSQEVEDKTR		ANEQLTDELA		QKTTTLTTTQ		RELSQLQELS		NHQKKRATEI
LNLLLKDLGE		IGGIIGTNDV		KTLADVNGVI		EEEFTMARLY		ISKMKSEVKS
LVNRSKQLES		AQMDSNRKMN		ASERELAACQ		LLISQHEAKI		KSLTDYMQNM
EQKRRQLEES		QDSLSEELAK		LRAQEKMHEV		SFQDKEKEHL		TRLQDAEEMK
KALEQQMESH		REAHQKQLSR		LRDEIEEKQK		IIDEIRDLNQ		KLQLEQEKLS
SDYNKLKIED		QEREMKLEKL		LLLNDKREQA		REDLKGLEET		VSRELQTLHN
LRKLFVQDLT		TRVKKSVELD		NDDGGGSAAQ		KQKISFLENN		LEQLTKVHKQ
LVRDNADLRC		ELPKLEKRLR		ATAERVKALE		SALKEAKENA		MRDRKRYQQE
VDRIKEAVRA		KNMARRAHSA		QIAKPIRPGH		YPASSPTAVH		AIRGGGGSSS
NSTHYQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білкових моторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brickley K., Smith M.J., Beck M., Stephenson F.A. (2005). GRIF-1 and OIP106, members of a novel gene family of coiled-coil domain proteins: association in vivo and in vitro with kinesin. J. Biol. Chem. 280: 14723—14732. PMID 15644324 DOI:10.1074/jbc.M409095200

Див. також

• Хромосома 2