PM20D1

PM20D1
Ідентифікатори
Символи	PM20D1, Cps1, peptidase M20 domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617124 MGI: 2442939 HomoloGene: 65049 GeneCards: PM20D1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides • lyase activity Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • обмін речовин • протеоліз • negative regulation of neuron death • cellular amino acid metabolic process • amide biosynthetic process • cellular amide catabolic process • cellular lipid metabolic process • energy homeostasis • adaptive thermogenesis • regulation of oxidative phosphorylation uncoupler activity • nitrogen compound metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	148811	212933
Ensembl	ENSG00000162877	ENSMUSG00000042251
UniProt	Q6GTS8	Q8C165
RefSeq (мРНК)	NM_152491	NM_178079 NM_001357478
RefSeq (білок)	NP_689704	NP_835180 NP_001344407
Локус (UCSC)	Хр. 1: 205.83 – 205.85 Mb	Хр. 1: 131.73 – 131.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PM20D1 (англ. Peptidase M20 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 55 741.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQRCVCVLA		LVAMLLLVFP		TVSRSMGPRS		GEHQRASRIP		SQFSKEERVA
MKEALKGAIQ		IPTVTFSSEK		SNTTALAEFG		KYIHKVFPTV		VSTSFIQHEV
VEEYSHLFTI		QGSDPSLQPY		LLMAHFDVVP		APEEGWEVPP		FSGLERDGII
YGRGTLDDKN		SVMALLQALE		LLLIRKYIPR		RSFFISLGHD		EESSGTGAQR
ISALLQSRGV		QLAFIVDEGG		FILDDFIPNF		KKPIALIAVS		EKGSMNLMLQ
VNMTSGHSSA		PPKETSIGIL		AAAVSRLEQT		PMPIIFGSGT		VVTVLQQLAN
EFPFPVNIIL		SNPWLFEPLI		SRFMERNPLT		NAIIRTTTAL		TIFKAGVKFN
VIPPVAQATV		NFRIHPGQTV		QEVLELTKNI		VADNRVQFHV		LSAFDPLPVS
PSDDKALGYQ		LLRQTVQSVF		PEVNITAPVT		SIGNTDSRFF		TNLTTGIYRF
YPIYIQPEDF		KRIHGVNEKI		SVQAYETQVK		FIFELIQNAD		TDQEPVSHLH
KL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1