El doctor John Watson reanuda su carrera médica al frente de una clínica dedicada al tratamiento de enfermedades raras seis meses después de la muerte de su amigo y compañero, Sherlock Holmes, a manos de Moriarty.
Un hombre con una bala en el cerebro dice ser un soldado escocés y oculta oscuros secretos. Watson investiga mientras busca al nuevo amor de Mary y ayuda a Ingrid a superar su tic al mentir.
Watson y los compañeros tratan a un cómico que se desmayó en una noche de micrófono abierto; el equipo se preocupa cuando el propio Watson se derrumba y sufre otra lesión cerebral traumática.
Sasha descubre un vínculo entre su paciente actual y un cadáver que diseccionó durante sus estudios de medicina, el equipo rastrea el caso hasta el país Amish.
Watson arriesga su carrera para tratar a un paciente con anemia falciforme con una cirugía poco ortodoxa. Mientras tanto, Ingrid intenta que su hermana sea admitida en su proyecto espinal.
Cuando una camgirl se desmaya durante una videollamada, Stephens busca la ayuda de Watson para encontrarla antes que sea tarde. Mientras tanto, Watson lucha con el dolor y la culpa por la muerte de Sherlock.
Mientras Watson ayuda a un paciente con graves pérdidas de memoria, lucha contra inquietantes alucinaciones que le hacen dudar de su propia cordura, sin saber que Moriarty acecha en las sombras.
Watson conoce a una amiga de Holmes cuando su hijo Angus llega al UHOP con parálisis. A medida que se encariña con el niño, sus colegas le apoyan en su búsqueda de una cura para su enfermedad.
Ingrid prueba su tratamiento experimental contra la parálisis en su hermana Gigi. Cuando empieza a mostrar efectos secundarios, el equipo se involucra. Mientras tanto, Mary y John estrechan lazos tras una tragedia.
El último paciente de la clínica, que está bajo tratamiento por el Síndrome de la Mano Extraterrestre, es sospechoso de empujar fatalmente a su hermano frente a un autobús. Watson debe determinar si es culpable o inocente.
Watson enfrenta un trauma del pasado, en el ejército, cuando la esposa de un amigo del ejército le pide ayuda, preocupada porque su marido está sufriendo un brote psicótico. Mientras tanto, Moriarty tiene una última tarea para Shinwell.
El equipo debe tomar una terrible decisión cuando parece que solo uno de los gemelos puede salvarse. Mientras tanto, Shinwell corre desesperadamente para ayudar y Watson finalmente confronta a Moriarty.