Isi Lambang Yayasan Nurul Muhajirin adalah :
- 4 Bintang terletak di sebelah kanan dan 4 bintang terletak di sebelah kiri serta 1 bintang terletak di ujung pertemuan tangkai padi dan kapas.
- Tangkai kapas dan padi yang melingkar terdapat 17 kuntum bunga kapas dan 45 butir padi.
- Delapan baris tulisan pada dua permukaan lembaran kitab suci.
- Kitab suci di atas alas terletak di tengah-tengah lambang.
- Nama “Yayasan Nurul Muhajirin” ditulis dalam pita di bawah kitab suci.
Warna Lambang Yayasan Nurul Muhajirin:
- Bintang berwarna kuning emas
- Bunga kapas berwarna hijau putih
- Delapan baris tulisan dalam kitab suci berwarna hitam
- Padi berwarna kuning emas
- Kitab suci berwarna kuning emas
- Alas kitab suci berwarna hitam
- Kalimat “Yayasan Nurul Muhajirin” berwarna putih
- Pita berwarna hijau
Makna warna-warni dalam Lambang Yayasan Nurul Muhajirin adalah sebagai berikut :
- Satu bintang Melambangkan kepemimpinan Nabi Muhammad SAW sebagai pemimpin umat manusia dan Rasulullah; Empat buah bintang lainnya melambangkan kepemimpinan Khulaur Rasyidin yaitu Abu Bakar Ash Shidiq, Umar bin Khattab, Utsman bin Affan, dan Ali bin Abi Thalib. Empat bintang di garis katulisitiwa melambangkan empat madzab yaitu Hanafi, Maliki, Syafii, dan Hambali. Jumlah bintang sebanyak 9 (sembilan) melambangkan sembilan wali penyebar agama Islam di pulau Jawa.
- 17 kuntum bunga kapas, 16 baris ayat dalam kitab suci dan 45 butir padi bermakna Proklamasi Kemerdekaan Negara Indonesia. Menunjukkan kebulatan tekad Yayasan Nurul Muhajirinuntuk membela Kemerdekaan Negara Kesatuan Republik Indonesia yang diproklamasikan pada tanggal 17 Agustus 1945.
- Butiran padi dan kapas yang melingkar berbentuk bulatan bermana bahwa Yayasan Nurul Muhajirin mengemban tugas untuk mewujudkan masyarakat yang sejahtera, adil, makmur, dan merata.
- Kitab suci bermakna bahwa pedoman hidup dan kehidupan yang serasi antara kebahagiaan duniawi dan ukhrowi, materiil, dan spirituil dengan ridho Allah SWT Tuhan Yang Maha Esa.
- Alas kitab suci bermakna bahwa pedoman hidup dan kehidupan harus ditempatkan pada proporsi yang sebenarnya sesuai dengan potensi dinamis dari kitab suci.
- Kelengkapan makna lambang Yayasan Nurul Muhajirin melukiskan Visi : “Terwujudnya insane yang beriman, bertaqwa, cerdas dan mandiri”.