Frågan blev akut på onsdagen då försvarsministeriets kanslichef Kusti Salm plötsligt meddelade om sin avgång och anklagade regeringen för tafatthet i försvarsfrågor.
Kanslichefen sa att både han och militärledningen upprepade gånger påtalat för regeringen att Estland lider av ammunitionsbrist och behöver skaffa mer ammunition för 1,6 miljarder euro för att kunna upprätthålla ett trovärdigt försvar.
– Olyckligtvis är Estland i dag i ett läge där något beslut inte fattats, sa Salm till rundradiobolaget ERR.
Tidigare har också den estniska försvarschefen general Martin Herem meddelat om sin avgång i förtid. Herem har krävt att Estland ska öka försvarsanslagen till fem procent av bnp och samtidigt fört fram kravet på ammunitionsinköp i miljardklassen.
Förvirring kring vem som visste vad
Premiärminister Kaja Kallas skyllde ifrån sig under en presskonferens på torsdagen och sa att hon hörde om ammunitionsbehovet i medierna.
Det ifrågasattes av den avgående överbefälhavaren general Herem som sa att han upprepade gånger tagit upp frågan i olika sammanhang.
– Regeringens medlemmar inklusive försvarsministern har garanterat varit medvetna, sa Herem till ERR.
Den förra utrikesministern Urmas Reinsalu beskyllde premiärminister Kallas för att ha ljugit och krävde hennes avgång.
– För mig är det en mycket allvarlig säkerhetsfråga att ett lands premiärminister i en sådan farlig situation ljuger för oss om frågor som rör det nationella försvaret för att försköna situationen eller bortförklara sina försummelser, sa Reinsalu som leder det näststörsta oppositionspartiet Isamaa.