lilToonMultiを使用したマテリアルのみ、距離クリッピングキャンセラーが有効になりません。
シェーダー設定では有効にすることはできますが、実際の挙動はlilToonMultiを使用したマテリアルのみ距離クリッピングキャンセラーが効かないという感じです。
lilToonMulti以外のlilToonやlilToonTransparent等であれば問題なく適用されます。

v2.2.1で再現します。
(v1.3.7, v1.8.5, v1.9.0, v1.10.3でも検証しましたが、検証手順が悪いのか全バージョンで再現しました)

もしかすると仕様の挙動である可能性も考えておりますので、そうでしたらご指摘いただけると非常に助かります。