Varidnaviria
| Varidnaviria | |||
|---|---|---|---|
| Een capside-eiwit van een bacteriofaag in dit imperium met twee jelly roll-structuren.[1][2] | |||
| Taxonomische indeling | |||
| |||
| Imperium | |||
| Varidnaviria | |||
| Varidnaviria op | |||
| |||
Varidnaviria is een imperium van virussen waartoe alle DNA-virussen behoren die coderen voor capside-eiwitten waarin zogenaamde jelly roll-structuur voorkomt (een speciale vouwingsstructuur). De capside-eiwitten (capsomeren) vormen pseudohexamere subunits. Binnen de capside is het virale desoxyribonucleïnezuur (DNA) opgeslagen. Naast de jelly roll kenmerken deze virussen ook door de enzymen ATPase die het viraal DNA in de capside verpakken en een gespecialiseerde DNA-polymerase dat het virale genoom repliceert.[3]
Varidnaviria werd in 2019 vastgesteld op basis van geconserveerde eiwitstructuren. Binnen het imperium worden twee hoofdgroepen (rijken) onderscheiden op basis van hun jelly roll-structuur. Virussen met een dubbele jelly roll behoren tot het rijk Bamfordvirae, virussen met een enkele jelly roll tot de Helvetiavirae. Bijna alle DNA-virussen die eukaryoten infecteren maken deel uit van dit imperium.
Veel virussoorten in dit imperium komen voor in zee. Ze zijn zeer talrijk en spelen een belangrijk rol in de mariene ecologie.[4] De dierenvirussen in het imperium, zoals de adenovirussen of pokkenvirussen, zijn de oorzaak van bekende infectieziekten. Pokkenvirussen hebben een grote rol gespeeld in de geschiedenis van de geneeskunde. Pokken was het doelwit van een van de eerste vaccins en zou later als eerste ziekte ziekteverwekker definitief worden uitgeroeid. Het imperium omvat ook reuzenvirussen die fysiek veel groter zijn en veel meer genen bevatten dan gewone virussen.
Classificatie
[bewerken | brontekst bewerken]Varidnaviria valt uiteen in twee rijken: Bamfordvirae en Helvetiavirae, waarvan de laatste monotypisch is tot aan de rang familie. Deze taxonomie kan als volgt worden weergegeven.[3][5]
- Rijk: Bamfordvirae, met een dubbele jelly roll-structuur
- Rijk: Helvetiavirae, met een enkele jelly roll-structuur
- Fylum: Dividoviricota
- Klasse: Laserviricetes
- Orde: Halopanivirales
- Familie: Sphaerolipoviridae
- Orde: Halopanivirales
- Klasse: Laserviricetes
- Fylum: Dividoviricota
Alle erkende vertegenwoordigers van Varidnaviria behoren tot Groep I van de Baltimore-classificatie: de dsDNA-virussen die gegroepeerd zijn op basis van hun genoomstructuur en wijze van mRNA-synthese. Mogelijk behoort ook de familie Finnlakeviridae, die bij Groep II wordt ingedeeld (de ssDNA-virussen) tot dit imperium.[3] Het imperium is het hoogste taxonomische niveau dat gebruikt wordt om virussen in te delen, en Varidnaviria is een van de vier. De andere zijn Duplodnaviria, Monodnaviria en Riboviria.
Zie ook
[bewerken | brontekst bewerken]Bronnen
- ↑ (en) Klose T, Rossman MG (2014). Structure of large dsDNA viruses. Biol Chem 395 (0): 711-719. PMID 25003382. DOI: 10.1515/hsz-2014-0145.
- ↑ (en) San Martin C, van Raaij MJ (2018). The So Far Farthest Reaches of the Double Jelly Roll Capsid Protein Fold. Virol J 15 (1): 181. PMID 30470230. DOI: 10.1186/s12985-018-1097-1.
- ↑ a b c (en) Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH, Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (2019). Geraadpleegd op 08-05-2021.
- ↑ (en) Kauffman KM, Hussain FA, Yang J, Arevalo P. (1 February 2018). A Major Lineage of Non-Tailed dsDNA Viruses as Unrecognized Killers of Marine Bacteria. Nature 554 (7690): 118-122. PMID 29364876. DOI: 10.1038/nature25474.
- ↑ (en) Virus Taxonomy: 2019 Release. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Geraadpleegd op 08-05-2021.