HIST1H3E

HIST1H3E
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4LLB, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4HON, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3KMT, 4YM6, 4A7J, 3UEE, 2KWK, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4LKA, 5CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3AZH, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2KWJ, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4YM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3SOU, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2B2U, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Ідентифікатори
Символи	H3C6, H3.1, H3/d, H3FD, histone cluster 1, H3e, histone cluster 1 H3 family member e, H3 clustered histone 6, HIST1H3E, H3C4, H3C7, H3C12, H3C2, H3C8, H3C10, H3C3, H3C1, H3C11
Зовнішні ІД	OMIM: 602813 MGI: 2448349 HomoloGene: 134113 GeneCards: H3C6
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • cadherin binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • мембрана • нуклеоплазма • хромосома • extracellular region • nuclear chromosome • екзосома • Нуклеосома • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • telomere organization • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • protein heterotetramerization • зсідання крові • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • rDNA heterochromatin assembly • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • nucleosome assembly • interleukin-7-mediated signaling pathway • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8353	319152
Ensembl	ENSG00000274750	ENSMUSG00000101355
UniProt	P68431	P68433
RefSeq (мРНК)	NM_003532 NM_001381999	NM_178206
RefSeq (білок)	NP_066298 NP_003520 NP_003525 NP_003527	NP_835513 NP_835514 NP_659539
Локус (UCSC)	Хр. 6: 26.22 – 26.23 Mb	Хр. 13: 21.9 – 21.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H3E (англ. Histone cluster 1 H3 family member a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 136 амінокислот, а молекулярна маса — 15 404.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARTKQTARK		STGGKAPRKQ		LATKAARKSA		PATGGVKKPH		RYRPGTVALR
EIRRYQKSTE		LLIRKLPFQR		LVREIAQDFK		TDLRFQSSAV		MALQEACEAY
LVGLFEDTNL		CAIHAKRVTI		MPKDIQLARR		IRGERA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Zhong R., Roeder R.G., Heintz N. (1983). The primary structure and expression of four cloned human histone genes. Nucleic Acids Res. 11: 7409—7425. PMID 6647026 DOI:10.1093/nar/11.21.7409
• Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
• Kardalinou E., Eick S., Albig W., Doenecke D. (1993). Association of a human H1 histone gene with an H2A pseudogene and genes encoding H2B.1 and H3.1 histones. J. Cell. Biochem. 52: 375—383. PMID 8227173 DOI:10.1002/jcb.240520402
• Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes. Gene. 184: 141—148. PMID 9031620 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
• Albig W., Kioschis P., Poustka A., Meergans K., Doenecke D. (1997). Human histone gene organization: nonregular arrangement within a large cluster. Genomics. 40: 314—322. PMID 9119399 DOI:10.1006/geno.1996.4592
• Albig W., Doenecke D. (1997). The human histone gene cluster at the D6S105 locus. Hum. Genet. 101: 284—294. PMID 9439656 DOI:10.1007/s004390050630

Див. також

• Хромосома 6