LST1

LST1
Ідентифікатори
Символи	LST1, B144, D6S49E, LST-1, leukocyte specific transcript 1
Зовнішні ІД	OMIM: 109170 MGI: 1096324 HomoloGene: 136814 GeneCards: LST1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7940	16988
Ensembl	ENSG00000230791 ENSG00000226182 ENSG00000231048 ENSG00000204482 ENSG00000206433 ENSG00000223465 ENSG00000234514 ENSG00000235915	ENSMUSG00000073412
UniProt	O00453	O08843
RefSeq (мРНК)	NM_001166538 NM_007161 NM_205837 NM_205838 NM_205839 NM_205840	NM_010734
RefSeq (білок)	NP_001160010 NP_009092 NP_995309 NP_995310 NP_995311 NP_995312	NP_034864
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.59 – 31.59 Mb	Хр. 17: 35.4 – 35.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LST1 (англ. Leukocyte specific transcript 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 97 амінокислот, а молекулярна маса — 10 792.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSRNDDICI		YGGLGLGGLL		LLAVVLLSAC		LCWLHRRVKR		LERSWAQGSS
EQELHYASLQ		RLPVPSSEGP		DLRGRDKRGT		KEDPRADYAC		IAENKPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пдтримання форми клітини, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mulcahy H., O'rourke K.P., Adams C., Molloy M.G., O'gara F. (2006). LST1 and NCR3 expression in autoimmune inflammation and in response to IFN-gamma, LPS and microbial infection. Immunogenetics. 57: 893—903. PMID 16362817 DOI:10.1007/s00251-005-0057-2
• Raghunathan A., Sivakamasundari R., Wolenski J., Poddar R., Weissman S.M. (2001). Functional analysis of B144/LST1: a gene in the tumor necrosis factor cluster that induces formation of long filopodia in eukaryotic cells. Exp. Cell Res. 268: 230—244. PMID 11478849 DOI:10.1006/excr.2001.5290

Див. також

• Хромосома 6