EHD3

EHD3
EH 도메인 (3개 포함)
식별자
기호.EDH3
Alt.과거 3
Alt. 이름과거 3

Eps15 호몰로지 도메인 함유 단백질 3은 EDH3 또는 PAST3로 약칭되며 EHD3 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.사람, 쥐, 쥐에게서 관찰되었다.그것은 대형 GTPases의 Dynamin 슈퍼패밀리와 관련된 4개의 막 리모델링 단백질 그룹인 EHD 단백질 패밀리에 속합니다.이들 4개는 7080%의 아미노산이 동일하지만 [1]위치가 다르다.그것의 주요 기능은 세포내 운반과 관련이 있다.

분류학적 식별자 9606 [NCBI]
길이(aa) 535
분자량(kDa) 60.887
분자량(g/mol) 60,887.13
외상으로 하겠습니다. 0.0
등전점 6.5173[2]
유전자형 단백질 코딩
유전자 위치 2p23.1
엑손수 7
유기체 호모 사피엔스
맞춤법 쥐와 쥐

구조.

일차 구조

단백질의 1차 구조는 단백질이 어떤 아미노산으로 구성되어 있는지와 관련이 있다.EHD3는 535개의 아미노산을 가지고 있으며, 그 중 거의 4분의 3은 4개의 EHD 단백질에서 흔하다.단백질은 분자량이 60887 달톤이다.

이차 구조

EHD3 단백질의 2차 구조는 아직 알려지지 않았다.

3차 구조

단백질의 3차 구조는 그것이 형성되는 도메인을 포함한다.EHD3 단백질은 4가지 도메인으로 구성됩니다.

  • EH 도메인 함유 단백질 N-말단, 24번째와 56번째 아미노산 사이.이것은 단백질의 시작 부분에서 발견될 수 있는 짧은 도메인으로, N-말단으로도 알려져 있으며, 많은 다이내믹과 EF-핸드 도메인을 포함하는 [3]단백질의 시작 부분에서 발견될 수 있습니다.
  • Board Game2+ Geek | Board Game Geek) 및 GTP 가수분해.GTP는 65번째와 72번째 아미노산 [4]사이에 위치한 뉴클레오티드 결합 영역을 통해 단백질에 결합된다.
  • 444번째와 532번째 아미노산 사이의 EH 도메인입니다그것은 모든 EHD 단백질에서 발견됩니다.접힘은 짧은 역평행 베타 시트로 연결된 두 개의 나선 루프 나선으로 구성된다.표적 펩타이드는 두 개의 알파 나선 사이의 소수성 영역에 결합되어 있다.EF-핸드 도메인 외에 티로신 인산화 부위 및 코일 코일도 포함할 수 있습니다.이 영역은 종종 단백질 운반, 선별 및 막 [5]밀매의 조절과 관련이 있다.
  • EF-핸드로 476번째와 511번째 아미노산 사이.EH 도메인의 일부를 구성합니다.489번째 아미노산과 500번째 아미노산 사이에 칼슘 이온(Ca2+) 결합을 가지며, 칼슘 이온과 선택적으로 비공유적으로 상호작용하여 단백질에 부착한다.
EHD3 단백질 도메인.주황색에서 EH 도메인을 포함하는 단백질 N-말단.노란색으로 표시된 것은 dynamin-type G 도메인입니다.감색에서는 코일 도메인입니다.녹색은 ED 도메인입니다.파란색은 EF-핸드 도메인입니다.

번역 후 수정

단백질 번역수정(PTM)은 기능기 또는 단백질의 공유 첨가, 아미노산끼리 결합하는 펩타이드 결합가수분해 또는 [6]단백질의 다른 부분의 분해에 의해 단백질의 기능 다양성을 증가시킨다.EHD3 단백질은 세 가지 종류의 아미노산 변형을 겪습니다.

  • 아세틸화N [7]말단에 아세틸기를 부착하는 것으로 구성됩니다.따라서 첫 번째 아미노산은 N-아세틸메티오닌이다.
  • 크로스 링크그것은 두 개의 단백질 또는 같은 단백질의 두 부분을 공유 결합과 연결하는 것을 포함한다.EHD3의 경우 리신과 글리신 사이에 이소펩타이드 결합인 2개의 가교가 있다.그것들은 315번째와 511번째 아미노산에 있습니다.
  • 인산화.인산염기(HPO3)의 첨가로 구성됩니다.EHD3에는 349번째 아미노산과 456번째 아미노산의 두 가지 세린 인산화 작용이 있다.
EHD3 번역변경.빨간색은 아세틸화.핑크색, 크로스 링크.보라색으로는 인산화입니다.

기능들

EH 도메인은 세포내 밀매에 관여하는 단백질군의 일반적인 모티브이다.이 4종류의 패럴로그(EHD1-EHD4)는 수용체 세포 내 밀매, 특히 혈장막 내부화와 재활용에 관여하고 있다.EHD 단백질의 기능 목록은 이제 [8]막 채워지기 시작했다.

EHD3는 달빛을 비추는 단백질로, 이는 단백질이 위치한 조직에 따라 다른 기능을 수행할 수 있다는 것을 의미한다.주요 기능은 다음과 같습니다.

  • 세포내 운반에 참여하다.EHD 계열 단백질은 세포 내 세포 운반과 직접적인 관련이 있는 것으로 나타났다.EHD1(EHD3의 [9]가장 가까운 패럴로그)은 ERC에서 플라즈마막으로 내부화된 분자의 출구를 제어함으로써 막 재활용을 가능하게 하는 역할을 담당한다.또한 이러한 EHD 단백질은 EH-NPF 상호작용을 통해 Rab11-이펙터 Rab11-FIP2에 결합하는 것으로 밝혀졌다.이러한 연관성은 뉴클레오티드를 결합하는 능력에 의해 영향을 받는다.Rab11 이펙터에 결합된 EHD1의 역할은 명확하지만(상기), EHD3와 Rab11-FIP2의 명확한 관계는 발견되지 않았습니다.그러나 EHD3 단백질이 녹다운을 겪었을 때 ERC에 대한 내부화된 트랜스페린 및 초기 내염색체 단백질의 전달이 방지되었고, 심지어 Rab11-FIP2의 세포하 위치도 변화하였다.따라서, EHD 단백질과 Rab11-FIP2의 조정된 역할은 세포내 재활용을 매개하는 데 있으며, 구체적으로는 EHD3, ERC [10][11]수송에 대한 초기 엔도솜에 대해 발견되었다.
  • ATP 가수분해 [12]시 막 재구성을 제어한다.
  • 포스파티드산 막의 튜브 [13]활성을 유도한다.
  • D1 도파민 [14]수용체를 재활용하기 위해서.
EHD3는 신장, 난소, [15]간뿐만 아니라 인간의 심장과 뇌에서 주로 발견될 수 있다.

인간의 EHD3 단백질을 코드하는 유전자는 2번 염색체, 특히 23.1번 영역에 위치한다.반면 쥐 EHD3 유전자는 염색체 17번, 21번 영역에 있다.인간의 유전자는 약 35,438개의 [16]염기로 형성된다.

인간과 생쥐 유전자 모두 3'에 반복되는 다형성(CA)을 포함한다.UTR. 구체적으로 인체 조직은 2종, 4.2kb 및 3.6kb의 EHD3 RNA 종을 나타낸다.유전자는 심장과 뇌에서 많이 발현되는 반면 신장, 난소, 간, 태반에서 적당히 발현된다.

위치

인간과 쥐에게서 EHD3 단백질이 발견되었다.그것은 신장, 난소, 간뿐만 아니라 인간의 심장과 뇌에서 주로 발견될 수 있다.

EHD3(녹색 형광 융합 단백질로 표현됨)는 주로 재활용 소포와 N-말단 도메인을 포함하는 막 세관에 국소화되었습니다.따라서 이 단백질이 미세관의존성 운동을 조절하는 것은 드문 일이 아니다.

병리학

돌연변이 발생

  • 위치 65에서의 돌연변이(G → R):그것은 글리신과 아르기닌의 변화이다.65번째와 72번째 아미노산 사이에 뉴클레오티드 결합이 있는 반면, 첫 번째 아미노산의 돌연변이는 ATP 결합을 폐지한다.
  • 위치 203에서의 돌연변이(V→P): 발린을 프롤린으로 치환한다.다이너믹 구아닌 뉴클레오티드 결합 도메인의 코일형 코일에 위치한다.그것은 내염색체 재활용 구획(ERC)에서 [17]혈장막으로의 소포 수송을 조절하는 단백질인 Rab11-FIP2와의 올리고머화와 상호작용을 감소시킨다.
  • 위치 315에서의 돌연변이(K→R): 아르기닌이 리신을 치환한다.그것은 같은 아미노산에 위치한 가교 기능을 폐지한다.따라서 단백질은 R-511을 합칠 수 없다.또한 ERC의 관상 구조에서의 위치 파악에도 영향을 미칩니다.
  • 위치 485에서의 돌연변이(W→A): 트립토판을 알라닌에 의해 변화시킨다.코일 코일은 아니지만 위치 203의 돌연변이와 마찬가지로 Rab11-FIP2와의 상호작용을 폐지한다.
  • 위치 511에서의 돌연변이(K→R): 위치 315에서의 돌연변이와 마찬가지로 리신을 아르기닌으로 치환하여 가교체를 섬모일화를 할 수 없다.단, 이 크로스 링크는 R-511이 [18]아닌 R-315와 관련되어 있습니다.
EHD3의 주요 돌연변이.

질병.

인체에서 이 단백질의 부족이나 오작동은 심부전이나[19] 우울증 질환과 같은 질병을 일으킬 수 있다.EHD3를 잃는 것은 또한 교종 형성을 위한 초기 단계로 알려져 있다.

주요 우울 장애(MDD)

그 이유는 아직 밝혀지지 않았지만, 여성들은 남성들보다 우울증 장애와 불안감에 더 민감하다.그럼에도 불구하고, 최근의 연구들은 일부 유전자와 그들의 암호화된 단백질과 EHD3를 포함한 질병과의 직접적인 관계를 보여주고 있다.MDD와 여성 환자만의 불안 행동과 구체적으로 연관된 유전자에서 3개의 SNP가 발견되었으며, 이는 MDD에서 [20]성별 분화 역할을 시사한다.

교종 형성의 EHD3

EHD3는 뇌 조직에서 가장 풍부하게 발현되기 때문에 뇌암 진행에서 EHD3의 역할을 연구해 왔다.

EHD3 유전자는 종양 억제 유전자로서의 기능을 가지고 있으며, 그 발현 상실은 교종에서 매우 흔한 현상이다.EDH3 전사 손실은 최하위 등급인 I와 II에서도 관찰되며, 이는 EHD3 손실이 교원 발생 중 초기 사건임을 시사한다.또한 EHD3는 성장억제 기능을 가지며 G/G1 세포주기 정지 및 아포토시스 사망을0 유도한다.EHD3의 프로아포토시스 역할은 인신매매에서의 역할과 관련되지 않고 오히려 EHD3의 ATP/GTP 결합 능력 및 단백질 키나아제 [21]시그널링에 대한 가능한 영향과 관련된 기능을 포함할 수 있다.

레퍼런스

  1. ^ "EHD Home Page: An ATPase involved in membrane remodelling". www.endocytosis.org. Retrieved 2016-10-15.
  2. ^ "Help - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 106".
  3. ^ EMBL-EBI, InterPro. "EH domain-containing protein, N-terminal (IPR031692) < InterPro < EMBL-EBI". www.ebi.ac.uk. Retrieved 2016-10-15.
  4. ^ EMBL-EBI, InterPro. "Dynamin-type guanine nucleotide-binding (G) domain (IPR030381) < InterPro < EMBL-EBI". www.ebi.ac.uk. Retrieved 2016-10-15.
  5. ^ EMBL-EBI, InterPro. "EH domain (IPR000261) < InterPro < EMBL-EBI". www.ebi.ac.uk. Retrieved 2016-10-15.
  6. ^ "Overview of Post-Translational Modifications (PTMs)". Thermo Fisher.
  7. ^ "Acetylation". www.uniprot.org. Retrieved 2016-10-16.
  8. ^ Chukkapalli S, Amessou M, Dekhil H, Dilly AK, Liu Q, Bandyopadhyay S, Thomas RD, Bejna A, Batist G, Kandouz M (April 2014). "Ehd3, a regulator of vesicular trafficking, is silenced in gliomas and functions as a tumor suppressor by controlling cell cycle arrest and apoptosis". Carcinogenesis. 35 (4): 877–85. doi:10.1093/carcin/bgt399. PMID 24306026.
  9. ^ Galperin E, Benjamin S, Rapaport D, Rotem-Yehudar R, Tolchinsky S, Horowitz M (August 2002). "EHD3: a protein that resides in recycling tubular and vesicular membrane structures and interacts with EHD1". Traffic. 3 (8): 575–89. doi:10.1034/j.1600-0854.2002.30807.x. PMID 12121420.
  10. ^ Norris PR (1977). "Thermoacidophilic archaebacteria: potential applications". Biochemical Society Symposium. 58 (1): 171–80. PMC 1445405. PMID 1445405.
  11. ^ "Ehd3 - EH domain-containing protein 3 - Mus musculus (Mouse) - Ehd3 gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2016-10-21.
  12. ^ Lu Q, Insinna C, Ott C, Stauffer J, Pintado PA, Rahajeng J, Baxa U, Walia V, Cuenca A, Hwang YS, Daar IO, Lopes S, Lippincott-Schwartz J, Jackson PK, Caplan S, Westlake CJ (March 2015). "Early steps in primary cilium assembly require EHD1/EHD3-dependent ciliary vesicle formation". Nature Cell Biology. 17 (3): 228–240. doi:10.1038/ncb3109. PMC 4344897. PMID 25686250.
  13. ^ Galperin E, Benjamin S, Rapaport D, Rotem-Yehudar R, Tolchinsky S, Horowitz M (August 2002). "EHD3: a protein that resides in recycling tubular and vesicular membrane structures and interacts with EHD1". Traffic. 3 (8): 575–89. doi:10.1034/j.1600-0854.2002.30807.x. PMID 12121420.
  14. ^ Kotowski SJ, Hopf FW, Seif T, Bonci A, von Zastrow M (July 2011). "Endocytosis promotes rapid dopaminergic signaling". Neuron. 71 (2): 278–90. doi:10.1016/j.neuron.2011.05.036. PMC 3417347. PMID 21791287.
  15. ^ "Tissue expression of EHD3 - Summary - The Human Protein Atlas". www.proteinatlas.org. Retrieved 2016-10-21.
  16. ^ "EHD3". www.genecards.org. Retrieved 2016-10-17.
  17. ^ "RAB11FIP2 - Rab11 family-interacting protein 2 - Homo sapiens (Human) - RAB11FIP2 gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2016-10-22.
  18. ^ "EHD3 - EH domain-containing protein 3 - Homo sapiens (Human) - EHD3 gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2016-10-22.
  19. ^ Gudmundsson H, Curran J, Kashef F, Snyder JS, Smith SA, Vargas-Pinto P, Bonilla IM, Weiss RM, Anderson ME, Binkley P, Felder RB, Carnes CA, Band H, Hund TJ, Mohler PJ (May 2012). "Differential regulation of EHD3 in human and mammalian heart failure". Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 52 (5): 1183–90. doi:10.1016/j.yjmcc.2012.02.008. PMC 3360944. PMID 22406195.
  20. ^ Wang L, Shi C, Zhang K, Xu Q (May 2014). "The gender-specific association of EHD3 polymorphisms with major depressive disorder". Neuroscience Letters. 567: 11–4. doi:10.1016/j.neulet.2014.02.055. PMID 24607927. S2CID 28116425.
  21. ^ Chukkapalli S, Amessou M, Dekhil H, Dilly AK, Liu Q, Bandyopadhyay S, Thomas RD, Bejna A, Batist G, Kandouz M (April 2014). "Ehd3, a regulator of vesicular trafficking, is silenced in gliomas and functions as a tumor suppressor by controlling cell cycle arrest and apoptosis". Carcinogenesis. 35 (4): 877–85. doi:10.1093/carcin/bgt399. PMID 24306026.