오믹스

Omics
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게놈을 나타내는 그림

비공식적으로 오믹스로 알려진 과학 분야는 유전체학, 단백질학, 대사학, 메타게노믹스, 페노믹스, 문자 전달학 등 접미사로 끝나는 생물학 분야이다.오믹스는 유기체나 유기체의 구조, 기능, 역학으로 변환되는 생물 분자 풀의 집합적 특성화와 정량화를 목표로 한다.

관련 접미사 -ome은 각각 게놈, 프로테옴, 대사체 등 해당 분야의 연구 대상을 언급하기 위해 사용된다.분자생물학에서 사용되는 접미사 -ome은 어떤 종류의 총체성을 가리킨다; 이것은 그리스어로 식별 가능한 접미사를 형성하지 않는 배열인 -μα의 다양한 그리스 용어에서 추상화하여 형성된 "neo-suffix"의 한 예이다.

기능성 유전체학은 주어진 유기체의 가능한 많은 유전자의 기능을 확인하는 것을 목표로 한다.그것은 문자 변환학, 프로테오믹스와 같은 다양한 -omics 기술과 포화 돌연변이 [1]컬렉션을 결합한다.

기원.

'오미쿰' : 에스토니아 타르투 대학의 에스토니아 게놈 센터와 분자 및 세포 생물학 연구소가 있는 에스토니아 바이오 센터 건물.

OED(Oxford English Dictionary)는 -ome 접미사에 대한 세 가지 응용 분야를 구분합니다.

  1. 의학에서 '종양'이라는 뜻을 가진 명사를 형성하는 것
  2. 식물학이나 동물학에서 '특정 구조를 가진 동식물의 일부'라는 의미의 명사를 형성하는 것
  3. 세포와 분자 생물학에서 '전체 구성 요소'라는 의미의 명사를 형성하는 것

-oem 접미사는 -oma의 변형에서 유래하여 19세기 후반에 생산되었다.그것은 원래 경화체[2] 또는 [3]뿌리줄기와 같은 용어로 나타났다.이 모든 용어는 단일 접미사가 아니라 -θμα로 분석 가능한 배열인 -θμα,[4] 어간(통상 동사)에 속하는 -θ- 및 추상 명사를 형성하는 진짜 그리스 접미사인 -μα에서 유래했다.

OED는 그것의 세 번째 정의가 mitome의 [5]역형성으로부터 유래했다고 제안하고 있으며, 초기 증명에는 biome(1916년)[6]과 genom(1920년 [8]독일[7] Genom으로 처음 만들어짐)이 포함됩니다.

분자생물학에서 염색체와의 연관성은 잘못된 어원에 의한 것이다.염색체라는 단어는 그리스어 어간 δμ(α)- "색깔"과 δμ(α)- "몸"[8]에서 유래했다.δμα "body"는 진정 -μα 접미사를 포함하지만, 앞의 -μα-는 줄기를 형성하는 접미사가 아니라 단어의 어근의 일부이다.게놈은 유기체의 완전한 유전자 구성을 의미하기 때문에, 네오서픽스옴은 스스로를 "전체" 또는 "완성"[9]을 지칭하는 것으로 제안했습니다.

생물정보학자들과 분자생물학자들은 "옴" 접미사를 [citation needed]널리 적용한 최초의 과학자 중 한 명으로 꼽혔다.초기 지지자들은 MRC 센터, 생어 센터 및 EBI(유럽 생물정보학 연구소)와 같은 초기 생물정보학 연구소가 많았던 영국 캠브리지의 생물정보학자들을 포함했다. 예를 들어, MRC 센터는 첫 번째 게놈과 프로테옴 프로젝트를 [10]수행했다.

오믹스 연구의 종류

유전체학

  • 게놈:유기체의 게놈에 대한 연구.
    • 인지 유전체학:유전자 프로파일과 관련된 인지 과정의 변화에 대한 연구.
    • 비교유전체학:서로 다른 생물학적 종이나 변종에 걸친 게놈 구조와 기능의 관계에 대한 연구.
    • 기능 유전체:유전자와 단백질의 기능과 상호작용에 대해 설명합니다(대개 트랜스크립토믹스를 사용).
    • 메타노믹스:환경 샘플에서 직접 회수된 유전자 물질과 같은 메타제놈에 대한 연구.
    • 신경유전체학:신경계의 발달과 기능에 대한 유전적 영향 연구.
    • Pangenomics:특정 [11]종에서 발견된 유전자 또는 게놈의 전체 모음에 대한 연구.
    • 개인 유전체학: 개인의 유전체 배열과 분석에 관한 유전체학 분야.일단 유전자형이 알려지면, 개인의 유전자형을 출판된 문헌과 비교하여 특성 발현과 질병 위험을 결정할 수 있다.맞춤형 의료 지원

에피게노믹스

후생유전자는 단백질과 RNA 결합체, 대체 DNA 구조, 그리고 DNA의 화학적 변형을 포함한 게놈의 지지 구조이다.

  • 에피게노믹스:현대 기술에는 Hi-C에 의한 염색체 배치, 다양한 ChIP-seq 및 단백질 분화와 결합된 다른 배열 방법, 그리고 중황산염 배열과 같은 세포질의 화학적 변형을 찾는 배열 방법이 포함됩니다.
  • 핵체학:"핵체라고 불리는 복잡하고 역동적인 생물학적 시스템으로서의 세포 핵"[12][13]을 형성하는 게놈 구성 요소의 전체 세트에 대한 연구.4D 뉴클레오옴 컨소시엄은 2017년 국제 인간 후생유전자 컨소시엄(IHEC)에 공식 가입했다.

미생물학

  • 마이크로바이옴은 뚜렷한 물리적 화학적 특성을 가진 상당히 잘 정의된 서식지를 점유하는 특징적인 미생물 군집으로 정의된다.마이크로바이옴은 관련된 미생물을 지칭할 뿐만 아니라 그들의 활동 영역을 포괄하여 특정한 생태적 틈새를 형성합니다.시간과 규모의 변화가 일어나기 쉬운 역동적이고 상호작용적인 마이크로 생태계를 형성하는 마이크로바이옴은 진핵생물 숙주를 포함한 거시 생태계에 통합되어 있으며, 여기서 그 기능과 [14]건강에 매우 중요하다.

지질학

리피돔은 유기체나 시스템에 의해 생성된 특정 세트의 지질을 포함한 세포지질의 전체 보완체이다.

  • 지질학: 지질 경로와 네트워크에 대한 대규모 연구.질량 분석 기법을 사용한다.

프로테오믹스

프로테옴은 유기체나 시스템에 의해 생성된 특정 단백질 세트에 대한 변형을 포함한 단백질의 전체 보완체이다.

  • 단백질학: 단백질, 특히 단백질의 구조와 기능에 대한 대규모 연구.질량 분석 기법을 사용한다.
    • 화학단백질학:단백질-소분자 상호작용 연구에 사용되는 일련의 기술
    • 면역단백질학:면역 반응에 관여하는 단백질(단백질)의 대규모 세트 연구
    • 뉴트리프로테오믹스:식단의 영양성분과 비 영양성분의 분자표적 확인.단백질 발현 연구에 프로테오믹스 질량 분석 데이터를 사용한다.
    • 단백질유전체학:프로테오믹스와 유전체학이 교차하는 생물 연구의 새로운 분야입니다.유전자 주석을 위해 사용되는 단백질학 데이터.
    • 구조 유전체학:실험 및 모델링 접근법의 조합을 사용하여 주어진 게놈에 의해 코드화된 모든 단백질의 3차원 구조에 대한 연구.

글리코믹스

글리코믹스는 당과 탄수화물 같은 당에 대한 포괄적인 연구이다.

식품학

식품학(Foodomics)은 2009년 알레한드로 시푸엔테스(Alejandro Cifuentes)에 의해 "소비자의 웰빙, 건강, [15][16]지식을 향상시키기 위한 첨단 오믹스 기술의 적용과 통합을 통해 식품과 영양 분야를 연구하는 학문"으로 정의되었다.

문자 변환학

Transcriptome은 mRNA, rRNA, tRNA, 그리고 다른 비코드 RNA를 포함한 모든 RNA 분자의 집합으로, 하나 또는 세포 집단에서 생산된다.

  • 문자 변환:전사체, 그 구조 및 기능에 대한 연구.

대사체학

대사체는 생물학적 매트릭스 안에서 발견되는 작은 분자의 집합체이다.

  • 대사체학:대사물과 관련된 화학 작용에 대한 과학적 연구.그것은 "특정 세포 과정이 남기는 독특한 화학 지문에 대한 체계적인 연구"이며, 그들의 소분자 대사물 프로필에 대한 연구이다.
  • 메타경제학:병태생리학적 자극이나 유전자 변형에 대한 생체계의 동적 다파라미터 대사 반응의 정량적 측정

영양, 약리학 및 독극물학

  • 영양유전체학:인간 게놈, 영양, 건강의 관계를 연구하는 과학.
    • 영양유전학은 유전적 변이가 식단과 건강 사이의 상호작용에 미치는 영향을 연구한다.
    • 영양유전학:식품과 식품 성분이 유전자 발현에 미치는 영향에 관한 연구.영양소가 게놈, 프로테옴, 대사체에 미치는 영향 연구
  • 약제유전체학은 인간 게놈 내 변이의 합계가 약물에 미치는 영향을 조사한다.
  • 약미생물학은 인간 마이크로바이옴 내의 변이가 약물에 미치는 영향을 조사한다.
  • 독성유전학: 독성물질에 반응하여 유기체의 특정 세포 또는 조직 내에서 유전자와 단백질 활동에 대한 정보의 수집, 해석 및 저장을 다루는 과학 분야입니다.

문화

진화생물학의 근본적인 질문에서 영감을 얻어 Jean-Baptiste Michel과 Erez Lieberman Aiden을 중심으로 한 하버드 팀은 빅 데이터 수집과 분석을 [17]문화 연구에 적용하기 위한 미국 신어주의 컬쳐로믹스를 만들었습니다.

여러가지 종류의

해양생태계를 연구하기 위해 미생물학을 이용한 국립해양대기청 과학자
  • 미토인터랙텀
  • 정신유전체학: 유전체학 및 단백질학이라는 강력한 도구를 적용하여 정상적인 행동의 생물학적 기질 및 행동 이상으로 나타나는 뇌의 질병을 더 잘 이해하는 과정입니다.약물 중독 연구에 정신 유전체학을 적용함으로써, 궁극적인 목표는 이러한 장애에 대한 보다 효과적인 치료법뿐만 아니라 객관적인 진단 도구, 예방 조치, 그리고 궁극적인 치료법을 개발하는 것이다.
  • 줄기세포 유전체학:줄기세포 생물학에 도움을 주죠목표는 줄기세포를 인간의 생물학과 질병 상태를 이해하기 위한 선도적인 모델 시스템으로 확립하고 궁극적으로 임상 번역을 위한 진전을 가속화하는 것이다.
  • Connectomics:코넥텀에 대한 연구, 뇌의 신경 연결의 전체성.
  • 미생물학:특정 환경 틈새에 사는 미생물 군집의 게놈 연구.
  • 셀로믹스:생체영상법 및 생체정보학을 이용한 정량세포 분석 및 연구.
  • Tomomics:일반적으로 영상 질량 분석 [18]데이터를 사용하여 높은 공간 분해능으로 조직 또는 세포 생화학을 이해하기 위한 단층 촬영 및 Omics 방법의 조합입니다.
  • Ethomics:동물의 [19]행동에 대한 높은 처리량 기계 측정입니다.
  • 비디오믹스(또는 비디오오믹스):연속적인 이미지 시퀀스(또는 비디오)가 '장면'을 드러내는 돌연변이를 통해 시간을 통해 진화하는 단일 이미지를 포착하는 것으로 해석될 수 있는 유전체 원리에서 영감을 얻은 비디오 분석 패러다임.
  • 멀티오믹스:단일 스터디 또는 분석 [20]파이프라인에 서로 다른 오믹을 통합합니다.

omics에 관련 없는 단어

"만화"라는 단어는 "omics" 접미사를 사용하지 않는다; 그것은 그리스어 "ωμ(ο)-" (오미멘트)+"-" (형용사 접미사)-" ( fromμ(α".)-")-" (형용사 접미사)에서 유래되었다.

마찬가지로 "경제"라는 단어는 그리스어 "ικοο"(가계) + "ομμ"(법률 또는 관습)에서 "(μμ"(가계) - "((μ"(가계) - "(μ"(가계) - "(μ"(가계)-" + "(μ("(가계)-에서 "경제"가 합쳐졌다.접미사 -omics는 때때로 레이거노믹스와 같은 경제학 학파의 이름을 만들 때 사용됩니다.

현재 사용 현황

주요 기사:생물학의 오믹스 주제 목록

원래의 "게놈"을 넘어선 많은 "옴"들이 유용하게 되었고 연구 과학자들에 의해 널리 채택되었다.프로테오믹스는 단백질을 대규모로 연구하는 용어로 자리 잡았다."옴스"는 분야를 캡슐화하는 쉬운 줄임말을 제공할 수 있다. 예를 들어, 인터랙토믹스 연구는 유전자-유전자, 단백질-단백질 또는 단백질-리간드 상호작용의 대규모 분석과 관련하여 명확하게 인식될 수 있다.1990년대 [21]중반 이후 PubMed에서 이러한 용어가 폭발적으로 사용되면서 연구자들은 빠르게 오메와 오믹스를 연구하기 시작했다.

「 」를 참조해 주세요.

메모들

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추가 정보

외부 링크

무료 사전인 Wiktionary에서 -omics를 찾습니다.
  • Omics.org Omics 용어 및 개념 홈페이지아마도 처음 만들어진 omics 웹 페이지일 것입니다.
  • 참조/원본을 포함한 오믹 목록입니다.(CHI) Cambridge Health Institute가 관리합니다.