SUI1

SUI1
SUI1
PDB 1d1r EBI.jpg
대장균 yciH 유전자의 NMR 용액 구조.
식별자
기호.SUI1
팜PF01253
인터프로IPR001950
프로 사이트PDOC00862
SCOP22if1/SCOPe/SUPFAM

분자생물학에서 단일 도메인 단백질 SUI1은 종종 균류인 사카로미세스 세레비시아이(베이커 효모)에서 발견되는 번역 개시 인자이지만, 고세균뿐만 아니라 다른 진핵 생물과 원핵 생물에서도 발견된다.진핵생물에서는 진핵생물 번역 개시 인자 1(eIF1) 또는 [1]박테리아에서는 YciH로 알려져 있다.

기능.

SUI1은 eIF2와 이니시에이터 Met-tRNA의 iMet[2]지원을 받아 리보솜을 번역 개시 사이트로 유도하는 번역 개시 계수입니다.SUI1은 시작 코돈의 주위에 프리 개시 복합체를 안정화함으로써 올바른 시작 코돈(통상은 AUG)부터 번역 개시가 시작되도록 합니다.SUI1은 AUG 코돈에 대한 높은 초기 충실도를 촉진하여 비 AUG [3]코돈을 구별합니다.

그러나 대장균에서는 SUI1 상동 YciH가 스트레스 [4]중 번역의 저해제인 것으로 보인다.

구조.

SUI1 단백질의 1차 구조는 108개의 아미노산으로 구성되어 있다.단백질 도메인은 7-블레이드 베타프로펠러로 구성된 구조를 가지고 있으며, 또한 C-말단 [5]알파나선을 포함한다.SUI1의 상동성은 포유류, 곤충, 식물에서 발견되었다.SUI1은 또한 대장균(yciH), 헤모필루스 인플루엔자(HI1225), 메타노코커스 반닐리의 [5]단백질과 관련이 있다.

레퍼런스

  1. ^ 원핵생물+시작+미국 국립 의학 도서관 의학 주제 제목(MeSH)의 요인 3
  2. ^ Yoon HJ, Donahue TF (January 1992). "The suil suppressor locus in Saccharomyces cerevisiae encodes a translation factor that functions during tRNA(iMet) recognition of the start codon". Molecular and Cellular Biology. 12 (1): 248–60. doi:10.1128/mcb.12.1.248. PMC 364089. PMID 1729602.
  3. ^ Martin-Marcos P, Cheung YN, Hinnebusch AG (December 2011). "Functional elements in initiation factors 1, 1A, and 2β discriminate against poor AUG context and non-AUG start codons". Molecular and Cellular Biology. 31 (23): 4814–31. doi:10.1128/MCB.05819-11. PMC 3232919. PMID 21930786.
  4. ^ Osterman, IA; Evfratov, SA; Dzama, MM; Pletnev, PI; Kovalchuk, SI; Butenko, IO; Pobeguts, OV; Golovina, AY; Govorun, VM; Bogdanov, AA; Sergiev, PV; Dontsova, OA (2015). "A bacterial homolog YciH of eukaryotic translation initiation factor eIF1 regulates stress-related gene expression and is unlikely to be involved in translation initiation fidelity". RNA Biology. 12 (9): 966–71. doi:10.1080/15476286.2015.1069464. PMC 4615754. PMID 26177339.
  5. ^ a b Herrmannová A, Daujotyte D, Yang JC, Cuchalová L, Gorrec F, Wagner S, Dányi I, Lukavsky PJ, Valásek LS (March 2012). "Structural analysis of an eIF3 subcomplex reveals conserved interactions required for a stable and proper translation pre-initiation complex assembly". Nucleic Acids Research. 40 (5): 2294–311. doi:10.1093/nar/gkr765. PMC 3300007. PMID 22090426.
  6. ^ Fields C, Adams MD (January 1994). "Expressed sequence tags identify a human isolog of the suil translation initiation factor". Biochemical and Biophysical Research Communications. 198 (1): 288–91. doi:10.1006/bbrc.1994.1040. PMID 7904817.
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