Benutzer:Markus Prokott/Nidovirales
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Coronavirus | ||||||||||||
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Nidovirales (von lateinisch nidus ‚Nest‘) ist eine Virenordnung von RNA-Viren. Sie gehört zum Reich Orthornavirae und dieses zum Bereich Riboviria. Das Taxon Nidovirales bildet eine geschlossenen Abstammungsgemeinschaft von Viren, die in grundlegenden Replikationsmerkmalen übereinstimmen und sich dadurch von anderen RNA-Viren unterscheiden.
Darüberhinaus gibt es weitere typische Merkmale beim Genomaufbau, die bei sehr vielen oder fast allen Viren dieser Ordnung vorkommen. Diese umfassen z. B. den verschachtelten (englisch nested ‚ineinander verschachtelt‘) Genomaufbau, der ihnen ihren Namen gab, oder das Vorhandensein zweier großer, einander überlappender offener Leserahmen, die durch ein sog. ribosomales Frameshifting verbunden sind. Auch enthält die Ordnung überwiegend Viren mit sehr großem RNA-Genom, darunter einige der größten bekannten RNA-Genome überhaupt.
Die Viren der Ordnung Nidovirales werden fachumgangssprachlich Nidoviren (Einzahl: Nidovirus, abgekürzt: NV) genannt und gehören zu den Viren, deren Genom als positiv-polare Einzelstrang-RNA vorliegt. Ihr Genom ist linear und unsegmentiert (monopartit) und alle Nidoviren besitzen eine Virenhülle. Größere Unterschiede finden sich bei den Nidoviren andererseits bezüglich Form und Aufbau der Virenhülle, Geometrie bzw. Symmetrie des Virenkapsids und der Gesamtgenomgröße der einzelnen Viren.
Nidoviren infizieren Wirbeltiere und wirbellose Tiere und lösen dort vielfältige Arten leichter bis schwerer akuter und chronischer Erkrankungen aus. Die heute bekannteste Gruppe von Nidoviren ist die Familie Coronaviridae, die verschiedene humane Coronaviren enthält. Darunter auch SARS-CoV-2, das Coronavirus, dass die aktuelle COVID-19-Pandemie auslöst.
Erscheinungsbild
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Kapsid
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Das Kapsid ist ein Nukleokapsid. Es kommt in ikosaedrischer und helikaler Symmetrie vor. Die ikosaedrischen Kapside sind in der Regel isometrisch (gleichseitig). Innerhalb der helikalen Symmetrie bilden sich flexible schlauchartige (tubuläre) und starre stäbchenförmige (zylindrische) Formen aus. Die flexiblen Formen kommen sowohl lose gewunden, dicht gepackt als auch im weitesten Sinne ringförmig (toroid) vor. Die ringförmigen Erscheinungen wiederum schwanken dabei bei ein und demselben Virus zwischen halbmondförmig und fast zu einem geschlossenen Ring gebogen.[2][3]
Hülle
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Hülle, in die das Kapsid gepackt ist, ist bei den flexiblen Kapsid-Varianten meist kugel- bis eiförmig bis pleomorph, ansonsten entspricht sie der Kapsidform. Bei den starren stäbchenförmigen Kapsiden ist die Hülle dann stäbchenförmig (bazilliform).[2] Hier wurden aber auch bisher ungeklärte Pleomorphien in Richtung kugeliger Form beobachtet.[3]
Bei Toroviren sind die Kapside flexibel, im weitesten Sinne ringförmig (toroid) und schlauchartig (tubulär). Hier schmiegen sich Hülle und Kapsid in der Regel aneinander an und die Hülle ist meist nieren- bis halbmondförmig, kann bei einem Kapsid in Form eines fast geschlossenen Ringes aber auch unabhängig von der Kapsidform kugelförmig sein.[2]
Genetik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Genomstruktur
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ORF1a
- RFS
- ORF1b
- ORF1 (beim Planidovirus 1)
- ORF2 (beim Aplysia abyssovirus 1)
- 3'-ORFs
Proteindomänen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Nichtstrukturproteine
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Nichtstrukturproteine (NSPe): nsp1, nsp2, nsp3, ….
Andere Proteindomänen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Polyproteinverarbeitungsprodukte (abysso-leto fig4)
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Polyproteine
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- Replikase-Polyprotein 1a
- Replikase-Polyprotein 1ab
- Replikase-Polyprotein 1 (beim Planidovirus 1)
- Replikase-Polyprotein 2 (beim Aplysia abyssovirus 1)
Subgenomische Boten-RNAs
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Produzierte Proteine
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- Replikase-Polyproteine 1a und 1ab
- Nichtstrukturproteine (nonstructural proteins, abysso-leto refs)
- Replikase-Polyprotein 1 (beim Planidovirus 1)
- Nichtstrukturproteine (nonstructural proteins, abysso-leto refs)
- Subgenomische Boten-RNAs
- Struktur-Proteine
- Hilfsproteine
- Polyprotein 2 (beim Aplysia abyssovirus 1)
- Strukturelle Protease
- Struktur-Proteine
- Hilfsproteine
Proteinasen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- PLpro – [4]:Fig. 4[5]:Fig. 1A
- Von englisch coronavirus papain-like proteinase[6]:866 ‚Coronavirus-Papain-ähnliche-Proteinase‘.
- 3CLpro oder Mpro – [7]:2[4]:Fig. 4[5]:Fig. 1A
- Von englisch coronavirus 3C-like proteinase[6]:858 ‚Coronavirus-3C-ähnliche-Proteinase‘ bzw. englisch main proteinase[4]:Fig. 4 ‚Hauptprotease‘.
- Spro – [4]:Fig. 10
- Von englisch chymotrypsin-like structural proteinase[4]:Fig. 10 ‚Chymotrypsin-artige strukturelle Proteinase‘.
RNA-replikative Enzyme (planido 11)
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- NiRAN (englisch nidovirus RdRp-associated nukleotidyltransferase ‚Nidovirus-RdRp-assoziierte Nukleotidyltransferase‘)
- RdRp (englisch RNA-dependent RNA polymerase ‚RNA-abhängige RNA-Polymerase‘ (abysso-leto 2.5))
- ZBD (englisch (putative) zinc-binding domain ‚(mutmaßliche) Zinc-bindende Domäne‘)
- HEL1 (englisch superfamily 1 helicase ‚Superfamilie-1-Helikase‘)
Korrekturlese- und RNA-modifizierende Enzyme (planido 11)
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ExoN (englisch 3'-to-5' exoribonuclease ‚3'-to-5'-Exoribonuklease‘ (exon-article))
- NEndoU (englisch nidovirus uridylate-specific endoribonuclease ‚Nidovirus-Uridylat-spezifische Endoribonuklease‘ (niran-article))
Transmembran-Proteine
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Struktur-Proteine
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- E Hüllenprotein
- N (englisch nucleocapsid protein ‚Nukleokapsid-Protein‘ (planido 12))
- M (englisch transmembrane matrix protein ‚Transmembran-Matrixprotein‘ (planido 12))
- S (englisch spike glycoprotein ‚Spike-Glykoprotein‘ (planido 12))
- E1 (englisch alphavirus E1-like ‚Alphavirus-E1-artig‘ (abysso-leto fig10)
- HA Influenza-A-Virus-Hämagglutinin-artiges Protein (abysso-leto fig10)
- HE Torovirus-Hämagglutinin-Esterase (abysso-leto fig10)
- GP Oberflächen-Glykoprotein (abysso-leto fig10)
- Sonstige
Hilfsproteine
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]accessory proteins
Replikationsstrategie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]RTC
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Replikase
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Etymologie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Taxonomische Hintergründe
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Wirtsspektrum
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Nidoviren infizieren verschiedene Stämme der Wirbeltiere und wirbellose Tiere, darunter die Chordatiere (Chordata, einschließlich Mensch), die Gliederfüßer (Arthropoda) und die Weichtiere (Mollusca), womöglich auch die Nematoden (Nematoda). Bei den Chordatieren wurden bisher Infektionen bei Säugetieren, Sauropsiden (Vögel + Reptilien), Fischen und Amphibien gefunden. Bei den übrigen Wirbeltieren (der Überklasse der Rundmäuler) sind noch keine Fälle bekannt. Bei den wirbellosen Stämmen sind Nidoviren-Infektionen im Stamme der Gliederfüßer z. B. bei Insekten und Krebstieren (Crustacea) bekannt, außerdem bei verschiedenen Vertretern aus dem Stamme der Weichtiere.[4] Tatsächlich geht man sogar von einer großen Anzahl und Vielfalt von Nidoviren bei Wirbellosen aus, aber die Forschung ist in diesem Bereich noch nicht sehr fortgeschritten.
Tabelle: Wirtstaxa von Nidovirentaxa
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Unterordnungen: Abnidovirineae Arnidovirineae Cornidovirineae Mesnidovirineae Monidovirineae Nanidovirineae Ronidovirineae Tornidovirineae
Tabelle: Wirtslebensräume von Nidovirentaxa
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]| Wirtslebensräume | Nidovirentaxa | |
|---|---|---|
| terrestrisch (auch flugfähige und unterirdisch lebende Landtiere und Amphibien) | ||
| aquatisch |
Bedeutung
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Erkrankungen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Quellen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Literatur
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b c Autoren des neunten ICTV-Reports: Virus Taxonomy – Classification and Nomenclature of Viruses. Online-Ausgabe. Kap. „Nidovirales“. In: ICTV Reports. International Committee on Taxonomy of Viruses, 2011, abgerufen am 12. Juni 2020 (englisch, parallel archiviert am 2. April 2019 auf web.archive.org.).
- ↑ a b Irene Cano, David Stone, Jacqueline Savage, Gareth Wood, Brian Mulhearn, Joshua Gray, Nick Stinton, Stuart Ross, Michaela Bonar, Nick G. H. Taylor, Kelly S. Bateman, Stephen W. Feist: Isolation of a Chinook Salmon Bafinivirus (CSBV) in Imported Goldfish Carassius auratus L. in the United Kingdom and Evaluation of Its Virulence in Resident Fish Species. Artikel. In: Viruses. Band 12, Nr. 5, Artikelnr. 578. MDPI, 25. Mai 2020, ISSN 1999-4915, doi:10.3390/v12050578 (englisch, Volltext [PDF; 15,0 MB; abgerufen am 14. August 2020]).
- ↑ a b c d e f g h
Khulud Bukhari, Geraldine Mulley, Anastasia A. Gulyaeva, Lanying Zhao, Guocheng Shu, Jianping Jiang, Benjamin W. Neuman: Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus. In: Virology. Band 524, Ausgabe November 2018. Elsevier, 7. September 2018, S. 160–171, doi:10.1016/j.virol.2018.08.010, PMID 30199753, PMC 7112036 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 3,3 MB; abgerufen am 18. Mai 2020] „Coronavirinae“: heute „Orthocoronavirinae“).
- FUNDSTELLEN
- Zu Serpentovirinae-Wirten: „Nematoda?“ (S. 168, Fig. 10)
- FUNDSTELLEN
- ↑ a b Ogando NS, Ferron F, Decroly E, Canard B, Posthuma CC and Snijder EJ: The Curious Case of the Nidovirus Exoribonuclease: Its Role in RNA Synthesis and Replication Fidelity. In: Aartjan Te Velthuis (Hrsg.): Frontiers in Microbiology. Band 10, Artikelnr. 1813, 7. August 2019, doi:10.3389/fmicb.2019.01813, PMID 31440227, PMC 6693484 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 6,8 MB; abgerufen am 1. Juni 2020]).
- ↑ a b John Ziebuhr, Eric J. Snijder, Alexander E. Gorbalenya: Virus-encoded proteinases and proteolytic processing in the Nidovirales. Review Article. In: Journal of General Virology. Band 81, Nr. 4. Great Britain 1. April 2000, S. 853–879, doi:10.1099/0022-1317-81-4-853, PMID 10725411 (englisch, Volltext oder PDF-Volltext-Download-Website [abgerufen am 22. Mai 2020] Beachte auch Fußnote auf Seite 853!).
- ↑ NiRAN article
- ↑ Belege für infizierte Wirte / Wirtstaxa sind den Gesamtquellen (siehe Tabellentitel) und den jeweiligen Artikeln der zugeordneten Nidovirentaxa zu entnehmen. Nur, wo Wirte nicht in den entsprechenden Nidoviren-Artikeln angegeben sind (z. B. weil noch kein Artikel existiert), sind (einstweilen und sparsam) Belege bei den Nidoviren-Unterfamilien angegeben.
- ↑ Olivier's shrew virus 1 isolate Gkd-1, complete genome. Nidovirales > Arnidovirineae > Arteriviridae > Crocarterivirinae: Olivier's shrew virus 1. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Crocidura olivieri (en)): „host="Crocidura olivieri guineensis"“
- ↑ RecName: Full=Replicase polyprotein 1ab; AltName: Full=ORF1ab polyprotein; Contains: RecName: Full=Nsp1 papain-like cysteine proteinase; Short=PCP; Contains: RecName: Full=Nsp2 cysteine proteinase; AltName: Full=CP2; Short=CP; Contains: RecName: Full=Non-struc... Nidovirales > Arnidovirineae > Arteriviridae > Equarterivirinae: Equine arteritis virus Bucyrus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Equidae): „host="Equidae (horses)"“
- ↑ Forest pouched giant rat arterivirus isolate PREDICT-06509, complete genome. Nidovirales > Arnidovirineae > Arteriviridae > Heroarterivirinae: African pouched rat arterivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Cricetomys emini): „host="Cricetomys emini"“
- ↑ Simian hemorrhagic encephalitis virus isolate Sukhumi, complete genome. Nidovirales > Arnidovirineae > Arteriviridae > Simarterivirinae: Simian hemorrhagic encephalitis virus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Macaca mulatta): „host="Macaca mulatta"“
- ↑ Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2, complete genome. Nidovirales > Arnidovirineae > Arteriviridae > Variarterivirinae: Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Sus scrofa): „host="Sus scrofa"“
- ↑ Possum nidovirus isolate WPDV, complete genome. Nidovirales > Arnidovirineae > Arteriviridae > Zealarterivirinae: Wobbly possum disease virus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Trichosurus vulpecula): „host="Trichosurus vulpecula (Australian brushtail possum)"“
- ↑ a b c
Yassine Kasmi, Khadija Khataby, Amal Souiri, Moulay Mustapha Ennaji: Coronaviridae: 100,000 Years of Emergence and Reemergence. Buchkapitel. In: Moulay Mustapha Ennaji (Hrsg.): Emerging and Reemerging Viral Pathogens. Band 1: Fundamental and Basic Virology Aspects of Human, Animal and Plant Pathogens. Elsevier/Academic Press, 2020, ISBN 978-0-12-819400-3, S. 127–149, doi:10.1016/B978-0-12-819400-3.00007-7 (englisch, Volltext [PDF; 2,6 MB; abgerufen am 10. August 2020]).
- FUNDSTELLEN
- Zu Orthocoronaviridae-Wirten: „They affect most terrestrial and marine animals and humans, including dolphins, birds, cattle, woodpeckers, fish, etc.“ (S. 131)
- FUNDSTELLEN
- ↑ Berne virus isolate P138/72, complete genome. Nidovirales > Tornidovirineae > Tobaniviridae > Torovirinae: Berne virus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 25. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Equus caballus): „host="Equus caballus (horse)"“
- ↑ Bovine nidovirus TCH5, complete genome. Nidovirales > Tornidovirineae > Tobaniviridae > Remotovirinae: Bovine nidovirus TCH5. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 25. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Bos taurus): „host="Bos taurus"“
- ↑ (Fehlerhafter) Nukleotid-Eintrag bei NCBI und Taxonomie-Proposal bei ICTV:
- NUKLEOTID BEI NCBI: Chinese broad-headed pond turtle arterivirus strain WHWGC150683 1ab protein, hypothetical protein, and putative glycoprotein genes, complete cds. Nidovirales > Arnidovirineae > Cremegaviridae > Rodepovirinae: Chinese broad-headed pond turtle arterivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Virusnamensbestandteil „arterivirus“, Eintrag bei „host=“ und → Mauremys megalocephala (en); Achtung: falsche(!) Abstammungsliste unter „ORGANISM“): „host="Mauremys megalocephala"“
- SPREADSHEET DES PROPOSALS: J. Ziebuhr, S. Baker, R.S. Baric, R.J. de Groot, C. Drosten, A. Gulyaeva, B.L. Haagmans, B.W. Neuman, S. Perlman, L.L.M. Poon, I. Sola, A.E. Gorbalenya: 2019.020S-023S. Proposal-Spreadsheet in ZIP. In: International Committee on Taxonomy of Viruses (Hrsg.): Virus Taxonomy. History. Revision 2019, Spreadsheet-Name in ZIP: 2019.020S-023S.A.v2.Nidovirales.xlsx. EC 51, Berlin April 2019, Proposal-Code 2019.020S-023S (ictvonline.org [ZIP; 1,8 MB; abgerufen am 9. Juni 2020] ratifiziert im März 2020, noch nicht vollständig veröffentlicht, Proposal-Webseite auf ictvonline.org): Cremegaviridae | Rodepovirinae | […] | Chinturpovirus 1 | […] | Chinese broad-headed pond turtle arterivirus | CBHPTAV
- ↑ Guangdong greater green snake arterivirus strain LPSG2430 1ab protein, putative glycoprotein, and hypothetical protein genes, complete cds. Nidovirales > Arnidovirineae > Gresnaviridae > Reternivirinae: Guangdong greater green snake arterivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Cyclophiops major (en)): „host="Cyclophiops major"“
- ↑ Hainan oligodon formosanus arterivirus strain LPSF32245 1ab protein, putative glycoprotein, and hypothetical protein genes, complete cds. Nidovirales > Arnidovirineae > Olifoviridae > Gofosavirinae: Hainan oligodon formosanus arterivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Oligodon formosanus (en)): „host="Oligodon formosanus"“
- ↑ Strain Details for Guangdong chinese water skink coronavirus Strain ZGLXR118981. Nidovirales > Cornidovirineae > Coronaviridae > Orthocoronavirinae: Guangdong chinese water skink coronavirus. In: ViPR-Homepage. 2. Mai 2020, abgerufen am 16. Juni 2020 (englisch).
- ↑ Ball python nidovirus strain 07-53, complete genome. Nidovirales > Tornidovirineae > Tobaniviridae > Serpentovirinae: Ball python nidovirus 1. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Python regius): „host="Python regius"“
- ↑ Nanhai ghost shark arterivirus strain NHYJS6157 1ab protein, putative glycoprotein, and hypothetical protein genes, complete cds. Nidovirales > Nanidovirineae > Nanghoshaviridae > Chimanivirinae: Nanhai ghost shark arterivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Chimaeriformes): „host="Chimaera sp."“
- ↑ Wuhan japanese halfbeak arterivirus strain DSYS15584 1A, 1b protein, and hypothetical protein genes, complete cds. Nidovirales > Nanidovirineae > Nanhypoviridae > Hyporhamsavirinae: Wuhan japanese halfbeak arterivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Hyporhamphus): „host="Hyporhamphus sajori"“
- ↑ Chinook salmon bafinivirus isolate NIDO, complete genome. Nidovirales > Tornidovirineae > Tobaniviridae > Piscanivirinae: Chinook salmon bafinivirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Oncorhynchus tshawytscha): „host="Oncorhynchus tshawytscha"“
- ↑
ICTV-Eintrag und verwandter Artikel:
- EINTRAG: ICTV Taxonomy history: Alphaletovirus. In: Virus Taxonomy. International Committee on Taxonomy of Viruses, abgerufen am 26. August 2020 (englisch): „Nidovirales > Cornidovirineae > Coronaviridae > Letovirinae > Alphaletovirus“
- ARTIKEL: Khulud Bukhari, Geraldine Mulley, Anastasia A. Gulyaeva, Lanying Zhao, Guocheng Shu, Jianping Jiang, Benjamin W. Neuman: Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus. In: Virology. Band 524, Ausgabe November 2018. Elsevier, 7. September 2018, S. 160–171, Kapitel 2.3. Naming and etymology, doi:10.1016/j.virol.2018.08.010, PMID 30199753, PMC 7112036 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 3,3 MB; abgerufen am 18. Mai 2020] „Coronavirinae“: heute „Orthocoronavirinae“): “[…T]he NGS<Sic! Korrekt: ‚NSG‘> named the new genus Alphaletovirus<sic!> in the pending proposal.”
- ↑ Botrylloides leachii nidovirus strain SRR2729873, complete genome. Nidovirales > Mesnidovirineae > Medioniviridae > Tunicanivirinae: Botrylloides leachii nidovirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Botrylloides leachii (en)): „host="Botrylloides leachii"“
- ↑ Cavally virus isolate C79, complete genome. Nidovirales > Mesnidovirineae > Mesoniviridae > Hexponivirinae: Cavally virus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Aedes): „host="Aedes harrisoni"“
- ↑ Yellow head virus 3 isolate 20161017004 pp1ab gene, partial cds. Nidovirales > Ronidovirineae > Roniviridae > Okanivirinae: Yellow head virus 3. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Penaeus monodon): „host="Penaeus monodon"“
- ↑ Wenling nido-like virus 1 strain WLJQ99370 hypothetical protein, putative glycoprotein 1, and putative glycoprotein 2 genes, complete cds. Nidovirales > Ronidovirineae > Euroniviridae > Ceronivirinae: Wenling nido-like virus 1. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Crustacea): „host="crustacean"“
- ↑ Beihai hermit crab virus 4 strain BHJJX25971 1ab, putative glycoprotein 1, hypothetical protein, putative glycoprotein 2, and hypothetical protein genes, complete cds. Nidovirales > Ronidovirineae > Euroniviridae > Crustonivirinae: Beihai hermit crab virus 4. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 24. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Einsiedlerkrebse (englisch hermit crab)): „host="hermit crab"“
- ↑
ICTV-Eintrag und verwandter Artikel:
- EINTRAG: ICTV Taxonomy history: Tiamatvirinae. In: Virus Taxonomy. International Committee on Taxonomy of Viruses, abgerufen am 26. August 2020 (englisch): „Nidovirales > Abnidovirineae > Abyssoviridae > Tiamatvirinae“
- ARTIKEL: Khulud Bukhari, Geraldine Mulley, Anastasia A. Gulyaeva, Lanying Zhao, Guocheng Shu, Jianping Jiang, Benjamin W. Neuman: Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus. In: Virology. Band 524, Ausgabe November 2018. Elsevier, 7. September 2018, S. 160–171, Kapitel 2.3. Naming and etymology, doi:10.1016/j.virol.2018.08.010, PMID 30199753, PMC 7112036 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 3,3 MB; abgerufen am 18. Mai 2020] „Coronavirinae“: heute „Orthocoronavirinae“): “The NSG has also accepted our proposal to name the new family Abyssoviridae<sic!>, the new genus Alphaabyssovirus<sic!> and the new species Aplysia abyssovirus 1<sic!>.”
- ↑ Beihai Nido-like virus 1 strain BZL87871 hypothetical protein and putative structural polyprotein genes, complete cds. Nidovirales > Mesnidovirineae > Medioniviridae > Medionivirinae: Beihai Nido-like virus 1. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Turritella): „host="Turritella sea snails"“
- ↑ Planarian secretory cell nidovirus isolate UIUC, complete genome. Nidovirales > Monidovirineae > Mononiviridae > Mononivirinae: Planarian secretory cell nidovirus. National Center for Biotechnology Information, abgerufen am 26. August 2020 (englisch, vgl. Abstammungsliste unter „ORGANISM“, Eintrag bei „host=“ und → Schmidtea mediterranea (en)): „host="Schmidtea mediterranea"“
- ↑ François Ferron, Humberto J. Debat, Ashleigh Shannon, Etienne Decroly, Bruno Canard: A N7-guanine RNA cap methyltransferase signature-sequence as a genetic marker of large genome, non-mammalian Tobaniviridae. Artikel. In: NAR Genomics and Bioinformatics. Band 2, Nr. 1, Ausgabe März 2020, Artikelnr. lqz022, 19. Dezember 2019, doi:10.1093/nargab/lqz022 (englisch, Volltext [PDF; 2,2 MB; abgerufen am 21. August 2020] Preprint): “[…] (Xinzhou Nematode virus 6 and Xinzhou toro-like virus 1, from the Sectovirus 1 and Infratovirus 1 species, respectively), where the viruses were isolated from snake-associated nematodes (although the host and life-cycle has not been clearly assessed).”
- ↑ Susan Payne: Family Arteriviridae. Buchkapitel. In: Viruses. Elsevier/Academic Press, 2017, ISBN 978-0-12-803109-4, Chapter 18, S. 159–163, S. 160, Sp. 2, doi:10.1016/B978-0-12-803109-4.00018-0 (englisch, Volltext [PDF; 764 kB; abgerufen am 25. August 2020]): “To date they have been isolated only from vertebrate hosts and there are no known human pathogens among the arteriviruses […].”
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