La finale della 28ª edizione della Coppa delle Coppe UEFA è stata disputata l'11 maggio 1988 allo stadio della Meinau di Strasburgo tra Ajax e Malines. All'incontro hanno assistito circa 39 000 spettatori. La partita, arbitrata dal tedesco occidentale Dieter Pauly, ha visto la vittoria per 1-0 del club belga.
Le due rivelazioni dell'edizione, i futuri vincitori del Malines e i cadetti dell'Atalanta, entrano in campo al Comunale di Bergamo per la semifinale di ritorno.
L'Ajax di Barry Hulshoff esordì contro gli irlandesi del Dundalk battendoli con un risultato complessivo di 6-0. Agli ottavi di finale i tedeschi occidentali dell'Amburgo furono sconfitti con un risultato aggregato di 3-0. Ai quarti i Lancieri affrontarono gli svizzeri del Young Boys battendoli sia all'andata che al ritorno col risultato di 1-0. In semifinale i francesi dell'Olympique Marsiglia furono sconfitti in Francia 3-0, che rese del tutto indolore la sconfitta interna per 2-1.
Il Malines di Aad de Mos iniziò il cammino europeo contro i rumeni della Dinamo Bucarest vincendo con un risultato complessivo di 3-0. Agli ottavi gli scozzesi del St. Mirren vennero battuti 2-0 nella gara di ritorno a Paisley, dopo che l'andata si concluse a reti inviolate. Ai quarti di finale i Malinwa affrontarono i sovietici della Dinamo Minsk, passando il turno grazie alla vittoria casalinga per 1-0 e al pareggio per 1-1 di Minsk. In semifinale gli italiani dell'Atalanta, che partecipavano al campionato di seconda serie, furono sconfitti sia all'andata cha al ritorno col risultato di 2-1.
A Strasburgo va in scena la finale tra l'Ajax, campione in carica, e il sorprendente Malines, giunto in finale imbattuto. Per l'Ajax, nettamente favorita, la partita è subito in salita visto che dopo appena un quarto d'ora Danny Blind viene espulso per un fallo su Erwin Koeman. I Lancieri, che ingenuamente sottovalutano l'avversario, vanno in svantaggio nella seconda metà di gara grazie al gol di Piet den Boer. A tenere il risultato al sicuro ci pensa il portierone del Malines Michel Preud'homme e l'Ajax diventa così la quinta squadra a perdere in finale, da campione in carica.
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