Moreno fu scelto nel corso del settimo giro del Draft NFL 1998[1], con cui disputò una gara come titolare nella sua stagione da rookie. Nella successiva passò ai San Diego Chargers. Nella stagione 2000, Moreno sostituì un inefficace Ryan Leaf contro i Kansas City Chiefs e i Miami Dolphins, completando 27 passaggi su 53 per 241 yard e subendo due intercetti. Il 15 ottobre 2000 fu messo in panchina dopo avere perso due fumble su tre giocate contro i Buffalo Bills. Il 5 novembre, tuttavia, guidò un drive da Moreno da 73 yard che portò San Diego a segnare il field goal del vantaggio contro i Seattle Seahawks. Questi però rimontarono e vinsero 17-15. Il 19 maggio 2001, Moreno fu svincolato dai Chargers.
^(EN) 1998 National Football League Draft, Pro Football Hall of Fame. URL consultato il 7 ottobre 2012 (archiviato dall'url originale il 12 gennaio 2014).