DDB2
DDB2| DDB2 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | DDB2, DDBB, UV-XPE, 특정 DNA 결합 단백질 손상 2 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 600811 MGI: 1355314 HomoloGene: 83 GeneCard: DDB2 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Cr 11: 47.21 – 47.24Mb | Chr 2: 91.04 – 91.07Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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DNA 손상결합 단백질 2는 인간에서 DDB2 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5][6]
구조
2003년 라피치-오트린 외 연구진에서 표시한 대로 DDB2 유전자는 인간 염색체 11p11.2에 위치하며 약 24~26kb의 영역에 걸쳐 있으며 10개의 exon을 포함한다.[7]DDB2 단백질은 두 번째 엑손에서 하류에 위치한 5개의 퍼팅 WD40 반복측정(상호 상호작용이 가능한 약 40개의 아미노산 순서)을 함유하고 있다.DDB2에서 확인된 WD40 모티브는 염색질 단백질 인식에 관여하는 단백질의 특징이다.DDB2의 C-단자 영역(48 kDa 분자량 단백질)은 DDB1(더 큰 127 kDa 단백질)에 결합하는 데 필수적이다.이 두 단백질은 함께 UV에 손상된 DNA 결합 단백질 복합체를 형성한다.[8]
인간결핍
만약 인간이 DDB2 유전자의 각 사본에 돌연변이를 가지고 있다면, 이것은 XPE라고 불리는 가벼운 형태의 인간 질병 제로데르마 색소를 유발한다.[7]XPE 그룹의 환자들은 가벼운 피부과 발현을 가지고 있고 신경학적으로 영향을 받지 않는다.DDB2 유전자의 돌연변이는 DNA의 뉴클레오티드 분리수리에 결함을 일으킨다.이 결핍은 또한 경미하여 다른 XP 유전자의 XPA, XPB, XPC, XPD, XPF, XPG에서 결함이 있는 세포의 민감도에 비해 정상 보수 능력의 40~60%와 UV 빛에 대한 약간의 민감도를 보여준다.[9]
함수
손상된 DNA에 대한 결합
때 DDB2 DDB1과 복잡한 안에서 Wittschieben 에 al.,[10]에 의해, DNA에 UV가 하나의 타입을 포함하는 heterodimer DDB, 이 복잡한 자식은 강하게 형성하는 것을 보여 주DNA에 공유 결합 장애 없이 containing 불일치, 그리고 둘 다 mismat이 들어 있는“화합물”기 위해 DNA에 대한abasic 사이트에 광화학 반응 생성물[(6-4)광생성물질], light-induced.ches병변과 병변.헤테로디머 DDB는 또 다른 UV광 유도 광전자 유도체(Cyclobutane Pyrimidine Dimer)를 함유한 DNA에 중간 강도로 결합하고, DNA 손상이 없는 DNA에 약하게 결합한다.XP-E 환자에서 발견되는 DDB2 하위 유닛에서 아미노산 대체물을 포함하는 이단자 DDB 복합체는 손상된 DNA에 대한 결합이 매우 부족하기 때문에, 이단자의 DDB2 성분은 손상된 DNA에 대한 결합을 위한 특수성을 포함한다. DDB1과 DDB2는 각각 작용만으로 DNA를 결합하지 않는다.
크로마틴 리모델링
진핵 DNA를 크로마틴으로 포장하는 것은 그들의 행동 현장에 효소를 모아야 하는 모든 DNA 기반 과정에 장벽을 제공한다.DNA 수리의 중요한 세포 과정을 허용하려면, 염색질을 완화해야 한다.
DDB1과의 이질 복합체에서 유비퀴틴 리가아제 단백질 CUL4A와[11] 더욱 복잡하고 PARP1과[12] 함께 DDB2는 염색질 내에서의 UV 유도 손상에 빠르게 연관되며, 반최대 연관성이 40초 만에 완료된다.[11]DDB1과 DDB2에 모두 부착된 PARP1 단백질은 DNA 리모델링 단백질 ALC1을 유인하는 DDB2에 PARylates(다중-ADP 리보스 체인을 생성)한다.[12]ALC1의 작용은 DNA에 대한 UV 손상 부위의 염색질을 완화시킨다.이 이완은 뉴클레오티드 절연 보수 경로에 있는 다른 단백질이 색소로 들어가 시클로부탄 피리미딘 조광기의 UV 유도 유무에 의해 손상된 DNA를 복구할 수 있게 해준다.
기타 함수
주 외 [13]연구진은 2015년 DDB2가 히스톤 디아세틸라제 1과 2와의 상호작용을 통해 UV 유도 DNA 손상 후 히스톤 H3(H3K56Ac)에서 리신 56의 아세틸화를 하향 조절하는 것을 보였다.히스톤의 아세틸화 감소는 히스톤을 감싸고 있는 DNA의 관련 유전자의 전사를 감소시킨다.
주 외 [14]연구진은 2016년, 세포가 전리방사선에 노출된 후 DDB2가 세포주기 구속 및 동질 재조합 DNA 수리에 관여한다는 것을 보여주었다.
2016년에 Christmann 외 연구진은 발암성 벤조(a)피렌 대사물 BPDE에 대한 세포 노출이 DDB2의 즉각적이고 지속적인 상향 조절을 야기한다는 것을 보여주었다.[15]이것은 DNA에서 BPDE 인덕트를 제거하는데 기여했다.
2017년 판티니 등은 XRCC5 및 XRCC6(다른 명칭으로는 쿠 이단체를 구성하는 Ku80과 Ku70으로 알려져 있음)과 관련하여 DDB2가 전사 활동을 하는 것을 보여주었다.[16]전사에 대한 DDB2/Ku 효과는 비호몰성 종단 접합 DNA 수리에 대한 Ku 헤테로디머의 작용과는 별개다.
참조
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추가 읽기
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