DDX20

DDX20
DDX20
Protein DDX20 PDB 2oxc.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭DDX20, DP103, GEMIN3, DEAD-Box 헬리코아제 20
외부 IDOMIM: 606168 MGI: 1858415 HomoloGene: 5214 GeneCard: DDX20
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_007204

NM_017397

RefSeq(단백질)

NP_009135

NP_059093

위치(UCSC)Chr 1: 111.75 – 111.78MbChr 3: 105.59 – 105.59Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

DEAD-box 헬리코아제 20, 보석 관련 단백질 3(GEMIN3)로도 알려진 ATP 의존성 RNA 헬리코아제 DDX20은 인간에서 DDX20 유전자에 의해 암호화효소.[5][6]

함수

보존 모티브인 Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD)가 특징인 DEAD 박스 단백질은 Putative RNA 나선형이다.그것들은 변환 개시, 핵 및 미토콘드리아 스플라이싱, 리보솜스플라이소솜 조립과 같은 RNA 2차 구조의 변경을 포함하는 많은 세포 과정에 관여한다.이들의 분포 패턴으로 볼 때, 이 가족의 일부 구성원은 발생, 정자생식, 세포 성장 및 분열에 관여하는 것으로 여겨진다.이 유전자는 ATPase 활성이 있고 운동신경(SMN) 복합체 생존의 구성요소인 DEAD 박스 단백질을 인코딩한다.[6]SMN은 척추 근위축성 유전자 산물로, RNP에서 SMN 복합체의 기능에 촉매 역할을 할 수 있다.[6]

생물학적 시사점

이전의 연구에서는 DDX20이 간세포암에서 종양 억제제 역할을 하고 유방암에서 종양 촉진제 역할을 할 수 있다는 것이 밝혀졌다.DDX20 결핍은 마이크로RNA의 NF-κB 억제 작용을 손상시켜 NF-κB 활동을 강화하며, 마이크로RNA 기계 구성 요소의 조절 오류도 다양한 인체 질환의 병원생식에 관여할 수 있음을 시사한다.[7]간종양 억제기 역할을 하는 miRNA-140과 같이 DDX20의 결핍으로 miRNA-140 기능이 손상되면 miRNA의 이러한 후속 기능 손상은 간상화생식으로 이어질 수 있다.마찬가지로 DDX20은 NF-118B 경로를 통해 전립선암(PCA)의 진행을 촉진할 수 있다.[8][9]임상 기반 연구에서 양성 DP103/NF-170B 피드백 루프는 침습성 유방암에서 구성성 NF-170B 활성화를 촉진하고 이 경로의 활성화는 암 진행 및 항암화학요법 내성 획득과 관련이 있다는 것이 관찰되었다.그것은 DP103이 유방암 치료의 치료 목표로서 잠재력을 갖도록 만든다.[10]

상호작용

DDX20은 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG000064703 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000027905 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Grundhoff AT, Kremmer E, Türeci O, Glieden A, Gindorf C, Atz J, Mueller-Lantzsch N, Schubach WH, Grässer FA (July 1999). "Characterization of DP103, a novel DEAD box protein that binds to the Epstein-Barr virus nuclear proteins EBNA2 and EBNA3C". J Biol Chem. 274 (27): 19136–44. doi:10.1074/jbc.274.27.19136. PMID 10383418.
  6. ^ a b c "Entrez Gene: DDX20 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 20".
  7. ^ Takata, Akemi; Otsuka, Motoyuki; Yoshikawa, Takeshi; Kishikawa, Takahiro; Kudo, Yotaro; Goto, Tadashi; Yoshida, Haruhiko; Koike, Kazuhiko (2012-04-13). "A miRNA machinery component DDX20 controls NF-κB via microRNA-140 function". Biochemical and Biophysical Research Communications. 420 (3): 564–569. doi:10.1016/j.bbrc.2012.03.034. ISSN 1090-2104. PMID 22445758.
  8. ^ Takata, Akemi; Otsuka, Motoyuki; Yoshikawa, Takeshi; Kishikawa, Takahiro; Hikiba, Yohko; Obi, Shuntaro; Goto, Tadashi; Kang, Young Jun; Maeda, Shin (January 2013). "MicroRNA-140 acts as a liver tumor suppressor by controlling NF-κB activity by directly targeting DNA methyltransferase 1 (Dnmt1) expression". Hepatology. 57 (1): 162–170. doi:10.1002/hep.26011. ISSN 1527-3350. PMC 3521841. PMID 22898998.
  9. ^ Chen, Weiguo; Zhou, Peng; Li, Xiaowei (June 2016). "High expression of DDX20 enhances the proliferation and metastatic potential of prostate cancer cells through the NF-κB pathway". International Journal of Molecular Medicine. 37 (6): 1551–1557. doi:10.3892/ijmm.2016.2575. ISSN 1791-244X. PMC 4866965. PMID 27121695.
  10. ^ Shin, Eun Myoung; Hay, Hui Sin; Lee, Moon Hee; Goh, Jen Nee; Tan, Tuan Zea; Sen, Yin Ping; Lim, See Wee; Yousef, Einas M.; Ong, Hooi Tin (September 2014). "DEAD-box helicase DP103 defines metastatic potential of human breast cancers". The Journal of Clinical Investigation. 124 (9): 3807–3824. doi:10.1172/JCI73451. ISSN 1558-8238. PMC 4151228. PMID 25083991.
  11. ^ a b c d e Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (March 2002). "miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs". Genes Dev. 16 (6): 720–8. doi:10.1101/gad.974702. PMC 155365. PMID 11914277.
  12. ^ Nelson PT, Hatzigeorgiou AG, Mourelatos Z (March 2004). "miRNP:mRNA association in polyribosomes in a human neuronal cell line". RNA. 10 (3): 387–94. doi:10.1261/rna.5181104. PMC 1370934. PMID 14970384.
  13. ^ a b Carnegie GK, Sleeman JE, Morrice N, Hastie CJ, Peggie MW, Philp A, Lamond AI, Cohen PT (May 2003). "Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of Motor Neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs". J. Cell Sci. 116 (Pt 10): 1905–13. doi:10.1242/jcs.00409. PMID 12668731.
  14. ^ Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Yong J, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (March 2000). "Gemin4. A novel component of the SMN complex that is found in both gems and nucleoli". J. Cell Biol. 148 (6): 1177–86. doi:10.1083/jcb.148.6.1177. PMC 2174312. PMID 10725331.
  15. ^ Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (February 2002). "Gemin5, a novel WD repeat protein component of the SMN complex that binds Sm proteins". J. Biol. Chem. 277 (7): 5631–6. doi:10.1074/jbc.M109448200. PMID 11714716.
  16. ^ a b c d e f g h i j Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (December 1999). "Gemin3: A novel DEAD box protein that interacts with SMN, the spinal muscular atrophy gene product, and is a component of gems". J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083/jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
  17. ^ Meister G, Bühler D, Laggerbauer B, Zobawa M, Lottspeich F, Fischer U (August 2000). "Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins". Hum. Mol. Genet. 9 (13): 1977–86. doi:10.1093/hmg/9.13.1977. PMID 10942426.

추가 읽기