OTUB1

OTUB1
사용 가능한 구조
PDB	휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2ZFY, 3VON, 4DDG, 4DDI, 4DHz, 4I6L, 4LDT
식별자
에일리어스	OTUB1, OTB1, OTU1, HSPC263, OTU탈유비퀴티나아제, 유비퀴틴알데히드결합1
외부 ID	OMIM: 608337 HomoloGene: 134542 GenCards: OTUB1
유전자 위치(인간)
크르.	11번 염색체(인간)
끝.	64,001,811 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	전전두피질; ; 브로드만 10구역; ; 대상회; ; 췌관 세포; ; 브로드만 9구역; ; 핵액컴벤스; ; 편도체; ; 복부 피부; ; 우측 자궁관; ; 자궁내막간질세포;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ; ; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	시스테인형펩티드가수분해효소활성; NEDD8특이단백질가수분해효소활성; 티올의존성 탈유비퀴티나아제; 펩티드가수분해효소활성; 유비퀴틴 결합; GO:0001948 단백질 결합; 가수분해효소활성; 유비퀴틴단백질리가수분해효소결합;
셀룰러 컴포넌트	세포질; 세포외 엑소좀; 핵; 핵소체; 세포;
생물학적 과정	적응 면역 반응; 단백질 K48결합탈유비퀴티네이션; 면역계 과정; 단백질 분해; DNA 손상 자극에 대한 세포 반응; 이중 파단 수리에 대한 음의 조절; 히스톤H2AK63결합유비퀴티네이션부조절; 인터류킨-1에 대한 세포반응; DNA복구; 단백질탈유비퀴티네이션;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	55611
	없음
	ENSG00000167770
	없음
	Q96FW1
	없음
	NM_017670
	없음
	NP_060140
	없음
	위키데이터
인간 보기/편집

유비퀴틴티오에스테라아제 OTUB1은 오투베인-1이라고도 알려져 있으며, 사람에게서 OTUB1 ^[3]^[4]유전자에 의해 암호화되는 효소이다.대체 스플라이싱으로 인해 여러 개의 트랜스크립트 변형이 발생합니다.

기능.

오투베인-1은 예측된 시스테인 단백질 분해효소의 OTU 슈퍼패밀리의 구성원이다.코드화 단백질은 매우 특이적인 유비퀴틴 이소펩티다아제이며, 분기된 폴리유비퀴틴 사슬에서 유비퀴틴을 분리하여 리신⁴⁸ 결합 폴리유비퀴틴에 ^[5]특이하지만 리신⁶³ 결합 폴리유비퀴틴에는 특이하지 않다.그것은 면역 체계에서 사이토카인 유전자 전사를 억제하는 또 다른 유비퀴틴 단백질 분해효소 및 E3 유비퀴틴 연결효소와 상호작용합니다.폴리유비퀴틴 사슬 ^[4]성장을 위한 편집 기능을 제공함으로써 특정 유비퀴틴 의존 경로에서 기능하도록 제안되었다.

상호 작용

OTUB1은 RNF128^[6] 및 GNB2L1과 ^[5]상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000167770 - 앙상블, 2017년 5월
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추가 정보

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Makarova KS, Aravind L, Koonin EV (2000). "A novel superfamily of predicted cysteine proteases from eukaryotes, viruses and Chlamydia pneumoniae". Trends Biochem. Sci. 25 (2): 50–2. doi:10.1016/S0968-0004(99)01530-3. PMID 10664582.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Cloning and functional analysis of cDNAs with open reading frames for 300 previously undefined genes expressed in CD34+ hematopoietic stem/progenitor cells". Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10.1101/gr.140200. PMC 310934. PMID 11042152.
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Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). "Functional proteomics mapping of a human signaling pathway". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
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Juris SJ, Shah K, Shokat K, et al. (2006). "Identification of otubain 1 as a novel substrate for the Yersinia protein kinase using chemical genetics and mass spectrometry". FEBS Lett. 580 (1): 179–83. doi:10.1016/j.febslet.2005.11.071. PMID 16364312. S2CID 24766989.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000167770 - 앙상블, 2017년 5월

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid12704427-3] Balakirev MY, Tcherniuk SO, Jaquinod M, Chroboczek J (Apr 2003). "Otubains: a new family of cysteine proteases in the ubiquitin pathway". EMBO Rep. 4 (5): 517–22. doi:10.1038/sj.embor.embor824. PMC 1319179. PMID 12704427.

[entrez-4] "Entrez Gene: OTUB1 OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1".

[pmid18954305-5] Edelmann MJ, Iphöfer A, Akutsu M, Altun M, di Gleria K, Kramer HB, Fiebiger E, Dhe-Paganon S, Kessler BM (March 2009). "Structural basis and specificity of human otubain 1-mediated deubiquitination". Biochem. J. 418 (2): 379–90. doi:10.1042/BJ20081318. PMID 18954305.

[pmid14661020-6] Soares L, Seroogy C, Skrenta H, Anandasabapathy N, Lovelace P, Chung CD, Engleman E, Fathman CG (January 2004). "Two isoforms of otubain 1 regulate T cell anergy via GRAIL". Nat. Immunol. 5 (1): 45–54. doi:10.1038/ni1017. PMID 14661020. S2CID 27005972.

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