PTCH1

PTCH1
PTCH1
식별자
에일리어스PTCH1, BCNS, HPE7, NBCCS, PTC, PTC1, PTCH, PTCH11, 패치 적용 1
외부 IDOMIM: 601309 MGI: 105373 HomoloGene: 223 GenCard: PTCH1
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_008957
NM_001328514

RefSeq(단백질)

NP_001315443
NP_032983

장소(UCSC)Chr 9: 95.44 ~95.52 MbChr 13: 63.66 ~63.72 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

단백질 패칭 호몰로지 1은 패칭 패밀리의 일원인 단백질로, 사람 내에서는 PTCH1 [5][6]유전자에 의해 암호화된다.

기능.

PTCH1은 패치가 적용된 유전자 패밀리의 일원으로 배아 구조의 형성과 종양 발생에 관여하는 분비 분자인 소닉 헤지호그의 수용체이다.이 유전자는 종양 억제제 역할을 한다.PTCH1 유전자 생성물은 평활화라는 또 다른 단백질의 방출을 억제하는 막간 통과 단백질로, 소닉 헤지호그가 PTCH1에 결합하면 평활화가 방출되어 세포 증식을 신호로 한다.

임상적 의의

이 유전자의 돌연변이는 모반성 기저세포암 증후군(AKA Gorlin'[7]s Syndrome), 식도 편평상피암, 트리코 에피테아종, 방광의 전이세포암, 홀로프로센스증과 관련이 있다.대체 스플라이싱으로 인해 여러 개의 트랜스크립트 배리언트가 서로 다른 Isoform을 인코딩합니다.추가적인 스플라이스 변형이 설명되었지만, 이들의 전체 길이 시퀀스와 생물학적 유효성은 [6]현재 결정되지 않았다.

PTCH1의 돌연변이는 골린 증후군을 유발하고 돌연변이는 홀로프로센스증 [8][9][10]환자에서도 발견되었다.이들 환자 중 일부는 홀로프로센스증 특징 중 구순열과 구개열을 나타내며, PTCH1의 미센스 변종도 비염색성 구순열 환자[11]염기서열 선별에서 발견되었다.또한 PTCH1 내 또는 PTCH1 부근의 SNP 간 연관성은 비신드롬성 구순 [11][12]입천장과 관련이 있는 것으로 밝혀졌다.PTCH1의 돌연변이는 또한 수아세포종[13]관련이 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000185920 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000021466 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Johnson RL, Rothman AL, Xie J, Goodrich LV, Bare JW, Bonifas JM, Quinn AG, Myers RM, Cox DR, Epstein EH, Scott MP (Aug 1996). "Human homolog of patched, a candidate gene for the basal cell nevus syndrome". Science. 272 (5268): 1668–71. Bibcode:1996Sci...272.1668J. doi:10.1126/science.272.5268.1668. PMID 8658145. S2CID 9160210.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PTCH1 patched homolog 1 (Drosophila)".
  7. ^ Cantú-Reyna, Consuelo (2014). "Mutation in the PTCH1 tumor suppressor gene in gorlin syndrome. A case report". Acta Pediatr Esp. 72 (11): e407–e414. Retrieved 12 March 2019.
  8. ^ Ming JE, Kaupas ME, Roessler E, Brunner HG, Golabi M, Tekin M, Stratton RF, Sujansky E, Bale SJ, Muenke M (April 2002). "Mutations in PATCHED-1, the receptor for SONIC HEDGEHOG, are associated with holoprosencephaly". Hum. Genet. 110 (4): 297–301. doi:10.1007/s00439-002-0695-5. PMID 11941477. S2CID 32865658.
  9. ^ Rahimov F, Ribeiro LA, de Miranda E, Richieri-Costa A, Murray JC (December 2006). "GLI2 mutations in four Brazilian patients: how wide is the phenotypic spectrum?". Am. J. Med. Genet. A. 140 (23): 2571–6. doi:10.1002/ajmg.a.31370. PMID 17096318. S2CID 21019963.
  10. ^ Ribeiro LA, Quiezi RG, Nascimento A, Bertolacini CP, Richieri-Costa A (July 2010). "Holoprosencephaly and holoprosencephaly-like phenotype and GAS1 DNA sequence changes: Report of four Brazilian patients". Am. J. Med. Genet. A. 152A (7): 1688–94. doi:10.1002/ajmg.a.33466. PMID 20583177. S2CID 25445281.
  11. ^ a b Mansilla MA, Cooper ME, Goldstein T, Castilla EE, Lopez Camelo JS, Marazita ML, Murray JC (January 2006). "Contributions of PTCH gene variants to isolated cleft lip and palate". Cleft Palate Craniofac. J. 43 (1): 21–9. doi:10.1597/04-169R.1. PMC 2151847. PMID 16405370.
  12. ^ Moreno LM, Mansilla MA, Bullard SA, Cooper ME, Busch TD, Machida J, Johnson MK, Brauer D, Krahn K, Daack-Hirsch S, L'heureux J, Valencia-Ramirez C, Rivera D, López AM, Moreno MA, Hing A, Lammer EJ, Jones M, Christensen K, Lie RT, Jugessur A, Wilcox AJ, Chines P, Pugh E, Doheny K, Arcos-Burgos M, Marazita ML, Murray JC, Lidral AC (December 2009). "FOXE1 association with both isolated cleft lip with or without cleft palate, and isolated cleft palate". Hum. Mol. Genet. 18 (24): 4879–96. doi:10.1093/hmg/ddp444. PMC 2778374. PMID 19779022.
  13. ^ Jones DT, Jäger N, Kool M, Zichner T, Hutter B, Sultan M, Cho YJ, Pugh TJ, Hovestadt V, Stütz AM, Rausch T, Warnatz HJ, Ryzhova M, Bender S, Sturm D, Pleier S, Cin H, Pfaff E, Sieber L, Wittmann A, Remke M, Witt H, Hutter S, Tzaridis T, Weischenfeldt J, Raeder B, Avci M, Amstislavskiy V, Zapatka M, Weber UD, Wang Q, Lasitschka B, Bartholomae CC, Schmidt M, von Kalle C, Ast V, Lawerenz C, Eils J, Kabbe R, Benes V, van Sluis P, Koster J, Volckmann R, Shih D, Betts MJ, Russell RB, Coco S, Tonini GP, Schüller U, Hans V, Graf N, Kim YJ, Monoranu C, Roggendorf W, Unterberg A, Herold-Mende C, Milde T, Kulozik AE, von Deimling A, Witt O, Maass E, Rössler J, Ebinger M, Schuhmann MU, Frühwald MC, Hasselblatt M, Jabado N, Rutkowski S, von Bueren AO, Williamson D, Clifford SC, McCabe MG, Collins VP, Wolf S, Wiemann S, Lehrach H, Brors B, Scheurlen W, Felsberg J, Reifenberger G, Northcott PA, Taylor MD, Meyerson M, Pomeroy SL, Yaspo ML, Korbel JO, Korshunov A, Eils R, Pfister SM, Lichter P (August 2012). "Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma". Nature. 488 (7409): 100–5. Bibcode:2012Natur.488..100J. doi:10.1038/nature11284. PMC 3662966. PMID 22832583.

추가 정보

외부 링크