ImageJ pour Windows

Application Java scriptable pour le traitement d'images scientifiques

ImageJ est un programme de conception graphique basé sur Java dédié à l'analyse d'images que vous pouvez installer gratuitement sur vos ordinateurs de bureau Windows compatibles. Il peut fonctionner soit comme un applet en ligne soit comme une application téléchargeable. Plus important encore, cet outil de photographie vous permet d'afficher, d'éditer, d'analyser, de traiter, de sauvegarder et d'imprimer des images de 8 bits, 16 bits ainsi que 32 bits.

Sans oublier qu'il prend également en charge les types de fichiers image les plus courants, y compris TIFF, GIF, JPEG, BMP, PGM, DICOM, ASCII, FITS et des fichiers de données brutes au format texte comme des tableurs. ImageJ peut être une alternative notable à l' Image Analyzer de Meesoft et à JPEGsnoop de Calvin Hass.

À quoi sert ImageJ ?

Le principal objectif d'ImageJ est de calculer des surfaces et des valeurs de pixels qui seront extrêmement utiles pour les graphistes. Cependant, cela va un peu au-delà, vous permettant de mesurer des distances et des angles, de créer des histogrammes de densité et également des graphiques de profil de ligne. De plus, il fournit d'autres fonctions de traitement d'image standard telles que la manipulation du contraste, le renforcement, le lissage, la détection des contours et le filtrage médian, pour en mentionner quelques-uns. Les transformations géométriques comme le redimensionnement, la rotation et les retournements peuvent également être effectuées à l'aide de cet outil photo numérique.

La fonction de traitement des couleurs d'ImageJ est puissante et polyvalente, vous permettant d'effectuer une gamme d'analyses et de modifications basées sur la couleur sur les images. En particulier, elle prend en charge plusieurs espaces colorimétriques, y compris RGB, HSB, et CIE Lab, ce qui vous permet de traiter les images avec précision en fonction de leurs besoins d'analyse. Ce logiciel permet la séparation des couleurs, vous permettant de diviser une image en canaux de couleur individuels, qui peuvent ensuite être modifiés séparément.

Le logiciel de traitement d'image basé sur Java peut gérer des piles d'images — une série d'images multithread qui partagent une seule fenêtre. Avec cela, vous pouvez effectuer des opérations chronophages en parallèle sur du matériel multi-CPU.  Automatisez des tâches et créez des outils personnalisés grâce à ses macros préinstallées . Il peut générer du code macro à l'aide de l'enregistreur de commandes, tandis que l'utilisation d'un débogueur de macro vous autorisera à le déboguer. Il y a plus de 300 macros que vous pouvez apprécier dans l'application et plus de 500 plugins disponibles. 

ImageJ vs. Fiji

Pour mémoire, Fiji est comme ImageJ mais il est basé sur ImageJ2—une réécriture complète du premier volet pour les données d'image multidimensionnelles—à la place. Le développement de Fiji vise à fournir une distribution d'ImageJ2 avec de nombreux plugins intégrés. Il intègre un système de mise à jour qui génère une structure de menu ordonnée et une documentation omniprésente en fournissant des descriptions d'algorithmes détaillées et des tutoriels. Beaucoup recommandent Fiji plutôt qu'ImageJ, surtout pour les utilisateurs travaillant dans les sciences de la vie car il est équipé du plugin Bio-Formats.

Bio-Formats vous aidera grandement à ouvrir la majorité des formats de fichiers propriétaires que les fournisseurs de microscopes utilisent pour stocker des images. Par exemple, le visualiseur 3D qui implémente l'enregistrement, la segmentation et d'autres algorithmes avancés de traitement d'image par microscopie optique peut mieux visualiser les données. Le composant TrakEM2 qu'il contient a été utilisé avec succès et amélioré pour analyser les lignées neuronales dans les cerveaux de drosophiles larvaires.  Fiji vous permet de éviter le besoin d'installer plusieurs composants provenant de différentes sources.

Bon analyseur d'images

ImageJ est une solution d'analyse d'images décente et plus légère. Il se charge et s'exécute beaucoup plus rapidement ainsi que plus facilement pour les utilisateurs non-programmeurs. Puisqu'il se compose de la fonctionnalité 'Compiler et Exécuter' pour les plugins sans nécessiter que vous appreniez un système de gestion de code. Mais, si vous désirez un meilleur traitement qui offre également plus de macros et de plugins intégrés, Fiji sera une meilleure option, surtout si vous êtes dans le domaine des sciences de la vie.