ImageJ para Windows

Aplicación Java programable para el procesamiento de imágenes científicas

ImageJ es un programa de diseño gráfico basado en Java dedicado a analizar imágenes que puedes instalar de forma gratuita en tus escritorios Windows compatibles. Puede funcionar como un applet en línea o como una aplicación descargable. Más importante aún, esta herramienta de fotografía te permite mostrar, editar, analizar, procesar, guardar e imprimir imágenes de 8 bits, 16 bits y 32 bits.

Sin mencionar que también admite los tipos de archivos de imagen más comunes, incluidos TIFF, GIF, JPEG, BMP, PGM, DICOM, ASCII, FITS y archivos de datos en bruto en formatos de texto como hojas de cálculo. ImageJ puede ser una alternativa notable al Image Analyzer de Meesoft y al JPEGsnoop de Calvin Hass.

¿Para qué se utiliza ImageJ?

El propósito principal de ImageJ es  calcular áreas y valores de píxeles que serán extremadamente útiles para los diseñadores gráficos. Sin embargo, va un poco más allá, permitiéndote medir distancias y ángulos, crear histogramas de densidad y también gráficos de perfil de línea. Además, proporciona otras funciones estándar de procesamiento de imágenes como manipulación de contraste, nitidez, suavizado, detección de bordes y filtrado mediano, por mencionar algunas. Transformaciones geométricas como escalado, rotación y volteos también se pueden realizar utilizando esta utilidad de fotos digitales.

La característica de procesamiento de color de ImageJ es poderosa y versátil, permitiéndote realizar una variedad de análisis y modificaciones basadas en color en las imágenes. En particular, soporta varios espacios de color, incluyendo RGB, HSB y CIE Lab, lo que te permite manejar imágenes con precisión dependiendo de sus necesidades de análisis. Este software permite la separación de color, dejándote dividir una imagen en canales de color individuales, que luego pueden ser modificados por separado.

El software de procesamiento de imágenes basado en Java puede manejar pilas de imágenes, una serie multihilo de imágenes que comparten una sola ventana. Con esto, puedes realizar operaciones que consumen mucho tiempo en paralelo en hardware de múltiples CPU. Automatiza tareas y crea herramientas personalizadas a través de sus macros preinstaladas. Puede generar código de macro utilizando el grabador de comandos mientras que emplear un depurador de macros te autorizará a depurarlo. Hay más de 300 macros que puedes disfrutar dentro de la aplicación y más de 500 plugins disponibles.

ImageJ vs. Fiji

Para que conste, Fiji es como ImageJ pero está basado en ImageJ2, una reescritura completa de la primera entrega para datos de imagen multidimensionales. El desarrollo de Fiji tiene como objetivo proporcionar una distribución de ImageJ2 con muchos plugins empaquetados. Integra un sistema de actualización que genera una estructura de menú ordenada y documentación general al proporcionar descripciones detalladas de algoritmos y tutoriales. Muchos recomiendan Fiji sobre ImageJ, especialmente para usuarios que trabajan en ciencias de la vida, ya que está equipado con el plugin Bio-Formats.

Bio-Formats te ayudará enormemente a abrir la mayoría de los formatos de archivo propietarios que los proveedores de microscopios utilizan para almacenar imágenes. Por ejemplo, el visualizador 3D que implementa registro, segmentación y otros algoritmos avanzados de procesamiento de imágenes a través de microscopía de luz puede visualizar datos mejor. El componente TrakEM2 que contiene fue utilizado y mejorado con éxito para analizar linajes neuronales en cerebros de Drosophila larval.  Fiji te permite evitar la necesidad de instalar múltiples componentes de diferentes fuentes.

Buen analizador de imágenes

ImageJ es una solución de análisis de imágenes decente y más ligera. Se carga y funciona mucho más rápido así como más fácil para usuarios no programadores para operar. Dado que consiste en la función de ‘Compilar y Ejecutar’ para plugins sin requerir que aprendas un sistema de gestión de código. Pero, si anhelas un mejor procesamiento que también otorga más macros y plugins integrados, Fiji será una opción más fina especialmente si estás en el campo de las ciencias de la vida.