GABPA

GABPA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AWC, 1SXD, 2JUO
Ідентифікатори
Символи	GABPA, E4TF1-60, E4TF1A, NFT2, NRF2, NRF2A, RCH04A07, GA binding protein transcription factor alpha subunit, GA binding protein transcription factor subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 600609 MGI: 95610 HomoloGene: 1543 GeneCards: GABPA
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mitochondrion organization • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of megakaryocyte differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cellular response to dopamine • blastocyst formation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2551	14390
Ensembl	ENSG00000154727	ENSMUSG00000008976
UniProt	Q06546 Q8IYS3	Q00422
RefSeq (мРНК)	NM_001197297 NM_002040	NM_008065
RefSeq (білок)	NP_001184226 NP_002031 NP_002031.2	NP_032091
Локус (UCSC)	Хр. 21: 25.73 – 25.77 Mb	Хр. 16: 84.63 – 84.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GABPA (англ. GA binding protein transcription factor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 295.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKREAEELI		EIEIDGTEKA		ECTEESIVEQ		TYAPAECVSQ		AIDINEPIGN
LKKLLEPRLQ		CSLDAHEICL		QDIQLDPERS		LFDQGVKTDG		TVQLSVQVIS
YQGIEPKLNI		LEIVKPADTV		EVVIDPDAHH		AESEAHLVEE		AQVITLDGTK
HITTISDETS		EQVTRWAAAL		EGYRKEQERL		GIPYDPIQWS		TDQVLHWVVW
VMKEFSMTDI		DLTTLNISGR		ELCSLNQEDF		FQRVPRGEIL		WSHLELLRKY
VLASQEQQMN		EIVTIDQPVQ		IIPASVQSAT		PTTIKVINSS		AKAAKVQRAP
RISGEDRSSP		GNRTGNNGQI		QLWQFLLELL		TDKDARDCIS		WVGDEGEFKL
NQPELVAQKW		GQRKNKPTMN		YEKLSRALRY		YYDGDMICKV		QGKRFVYKFV
CDLKTLIGYS		AAELNRLVTE		CEQKKLAKMQ		LHGIAQPVTA		VALATASLQT
EKDN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Gugneja S., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1995). Four structurally distinct, non-DNA-binding subunits of human nuclear respiratory factor 2 share a conserved transcriptional activation domain. Mol. Cell. Biol. 15: 102—111. PMID 7799916 DOI:10.1128/MCB.15.1.102

Див. також

• Хромосома 21