NFKB1

NFKB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MDI, 1MDJ, 1MDK, 1NFI, 1SVC, 2DBF, 2O61, 3GUT
Ідентифікатори
Символи	NFKB1, EBP-1, KBF1, NF-kB1, NF-kappa-B, NF-kappaB, NFKB-p105, NFKB-p50, NFkappaB, p105, p50, CVID12, nuclear factor kappa B subunit 1, NF-kappa-B1, NF-kB, NF-kappabeta
Зовнішні ІД	OMIM: 164011 MGI: 97312 HomoloGene: 2971 GeneCards: NFKB1
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія, immunodeficiency, common variable, 12
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • actinin binding • identical protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • I-kappaB/NF-kappaB complex • нуклеоплазма • extracellular region • гіалоплазма • secretory granule lumen • specific granule lumen Біологічний процес • cellular response to interleukin-6 • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of vitamin D biosynthetic process • Fc-epsilon receptor signaling pathway • cellular response to mechanical stimulus • NIK/NF-kappaB signaling • stress-activated MAPK cascade • negative regulation of inflammatory response • GO:0097285 апоптоз • response to muscle stretch • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity • positive regulation of hyaluronan biosynthetic process • membrane protein intracellular domain proteolysis • inflammatory response • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of miRNA metabolic process • cellular response to nicotine • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of cholesterol transport • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0032697 negative regulation of cytokine production • positive regulation of lipid storage • cellular response to dsRNA • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interleukin-1 • вроджений імунітет • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of gene expression • neutrophil degranulation • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to angiotensin • interleukin-1-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4790	18033
Ensembl	ENSG00000109320	ENSMUSG00000028163
UniProt	P19838	P25799
RefSeq (мРНК)	NM_001165412 NM_003998 NM_001319226 NM_001382625 NM_001382626 NM_001382627 NM_001382628	NM_008689
RefSeq (білок)	NP_001158884 NP_001306155 NP_003989 NP_001369554 NP_001369555 NP_001369556 NP_001369557 NP_001158884.1 NP_001306155.1	NP_032715
Локус (UCSC)	Хр. 4: 102.5 – 102.62 Mb	Хр. 3: 135.29 – 135.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFKB1 (англ. Nuclear factor kappa B subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 105 356.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEDDPYLGR		PEQMFHLDPS		LTHTIFNPEV		FQPQMALPTD		GPYLQILEQP
KQRGFRFRYV		CEGPSHGGLP		GASSEKNKKS		YPQVKICNYV		GPAKVIVQLV
TNGKNIHLHA		HSLVGKHCED		GICTVTAGPK		DMVVGFANLG		ILHVTKKKVF
ETLEARMTEA		CIRGYNPGLL		VHPDLAYLQA		EGGGDRQLGD		REKELIRQAA
LQQTKEMDLS		VVRLMFTAFL		PDSTGSFTRR		LEPVVSDAIY		DSKAPNASNL
KIVRMDRTAG		CVTGGEEIYL		LCDKVQKDDI		QIRFYEEEEN		GGVWEGFGDF
SPTDVHRQFA		IVFKTPKYKD		INITKPASVF		VQLRRKSDLE		TSEPKPFLYY
PEIKDKEEVQ		RKRQKLMPNF		SDSFGGGSGA		GAGGGGMFGS		GGGGGGTGST
GPGYSFPHYG		FPTYGGITFH		PGTTKSNAGM		KHGTMDTESK		KDPEGCDKSD
DKNTVNLFGK		VIETTEQDQE		PSEATVGNGE		VTLTYATGTK		EESAGVQDNL
FLEKAMQLAK		RHANALFDYA		VTGDVKMLLA		VQRHLTAVQD		ENGDSVLHLA
IIHLHSQLVR		DLLEVTSGLI		SDDIINMRND		LYQTPLHLAV		ITKQEDVVED
LLRAGADLSL		LDRLGNSVLH		LAAKEGHDKV		LSILLKHKKA		ALLLDHPNGD
GLNAIHLAMM		SNSLPCLLLL		VAAGADVNAQ		EQKSGRTALH		LAVEHDNISL
AGCLLLEGDA		HVDSTTYDGT		TPLHIAAGRG		STRLAALLKA		AGADPLVENF
EPLYDLDDSW		ENAGEDEGVV		PGTTPLDMAT		SWQVFDILNG		KPYEPEFTSD
DLLAQGDMKQ		LAEDVKLQLY		KLLEIPDPDK		NWATLAQKLG		LGILNNAFRL
SPAPSKTLMD		NYEVSGGTVR		ELVEALRQMG		YTEAIEVIQA		ASSPVKTTSQ
AHSLPLSPAS		TRQQIDELRD		SDSVCDSGVE		TSFRKLSFTE		SLTSGASLLT
LNKMPHDYGQ		EGPLEGKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Bours V., Villalobos J., Burd P.R., Kelly K., Siebenlist U. (1990). Cloning of a mitogen-inducible gene encoding a kappa B DNA-binding protein with homology to the rel oncogene and to cell-cycle motifs. Nature. 348: 76—80. PMID 2234062 DOI:10.1038/348076a0
• Heron E., Deloukas P., van Loon A.P.G.M. (1995). The complete exon-intron structure of the 156-kb human gene NFKB1, which encodes the p105 and p50 proteins of transcription factors NF-kappa B and I kappa B-gamma: implications for NF-kappa B-mediated signal transduction. Genomics. 30: 493—505. PMID 8825636 DOI:10.1006/geno.1995.1270
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Palombella V.J., Rando O.J., Goldberg A.L., Maniatis T. (1994). The ubiquitin-proteasome pathway is required for processing the NF-kappa B1 precursor protein and the activation of NF-kappa B. Cell. 78: 773—785. PMID 8087845 DOI:10.1016/S0092-8674(94)90482-0
• Lin L., Ghosh S. (1996). A glycine-rich region in NF-kappaB p105 functions as a processing signal for the generation of the p50 subunit. Mol. Cell. Biol. 16: 2248—2254. PMID 8628291 DOI:10.1128/MCB.16.5.2248
• Matthews J.R., Botting C.H., Panico M., Morris H.R., Hay R.T. (1996). Inhibition of NF-kappaB DNA binding by nitric oxide. Nucleic Acids Res. 24: 2236—2242. PMID 8710491 DOI:10.1093/nar/24.12.2236

Див. також

• Хромосома 4