HLA-C

HLA-C
사용 가능한 구조물
PDB	휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	3BZF,%s4NT6,%s1EFX,%s1IM9, 1QD
식별자
별칭	HLA-C, D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, 주요 조직 적합성 복합체, 클래스 I, C, MHC
외부 ID	OMIM: 142840 호몰로진: 133080 GeneCard: HLA-C
유전자 위치(인간)
쳇.	6번 염색체(인간)
끝	31,272,130bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	핏덩어리; ; 림프절; ; 폐를 끼치다; ; 흉선; ; 결장의; ; 표백나무; ; 골수; ; 비장의;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	펩타이드 항원 결합; GO:0001948 단백질 결합;
셀룰러 컴포넌트	막의 적분 성분; 갑상선성 방피막; 골지 기구; 초기 내막막; 막으로 막다; 골지막; 플라즈마 막; 세포표면; 소포체성 망막; MHC급 I단백질복합체; ER에서 골기로 운반하는 방광막; 내시경적 망막의 내강측 적분 성분; 세포외 외성체; 비료 과립막; 재생 내막;
생물학적 과정	항원 처리 및 표시; MHC 등급 I, TAP 의존성을 통한 외생 펩타이드 항원의 항원 처리 및 표시; 면역 체계 과정; 인터페론 매개 신호 경로; MHC 등급 I을 통한 펩타이드 항원의 항원 처리 및 표시; MHC 등급 I, TAP 독립성을 통한 외생 펩타이드 항원의 항원 처리 및 표시; I형 인터페론 신호 경로; 면역 반응; 면역 반응 조절; GO:0022415 바이러스 처리; 중성미자 분해;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	3107
	n/a
ENSG00000204525; ENSG00000233841; ENSG00000228299; ENSG00000225691; ENSG00000206435;
	ENSG00000237022; ENSG00000206452
	n/a
	P10321
	n/a
	NM_002117; NM_001243042
	n/a
	NP_001229971; NP_002108
	n/a
	위키다타
인간 보기/편집

HLA-C는 MHC(인간=HLA) 1급 헤비 체인 수용체에 속한다.C 수용체는 HLA-C 성숙 유전자 제품과 β2-마이크로글로불린으로 구성된 헤테로디머다.성숙한 C 체인은 막에 닻을 내리고 있다.HLA-C와 같은 MHC Class I 분자는 거의 모든 세포에서 발현되며, 면역체계에 작은 펩타이드를 분비하여 비자체 펩타이드에 대해 조사한다.

HLA-C는 Class-I MHC 수용체인 많은 HLA-C 알레르기를 암호화하는 6번 염색체의 중심이다.HLA-C는 HLA-B 위치 근위부에 국부적으로 위치하며, HLA 영역의 원위부에 위치한다.대부분의 HLA-C:B happlotype은 불안정하고 강한 연관성을 가지고 있으며 많은 것들이 인간 그 자체만큼이나 오래되었다.

질병 연관성

세로타입으로

Cw1: 다항식 고리기^[3]

alle로

C*16: B 만성 림프구 백혈병^[4]

명명법

C*01

Cw1 세로타입:C*01:02 및 C*01:09
Cw11
C*01:04 ~ *01:08

C*02

Cw2 세로타입:C*02:02 및 *02:08
C*02:03 ~ *02:07 및 02:09

C*03

Cw9 톱니형:C*03:03
Cw10 세로형:C*03:02, *03:04 및 *03:06
Cw3 세로타입:C*03:07
C*03:05 및 03:08

C*04

Cw4 세로타입:C*0401, *0407 및 *0410

C*05

Cw5 세로타입:C*05:01 및 *05:02
C*05:03 ~ *05:06 및 *05:08 ~ *05:10

C*06

Cw6 세로타입:C*06:02 및 *06:05
C*06:03, *06:04 및 *06:06 ~ *06:11
Cw7 세로타입:C*07:01 ~ *07:06, *07:12, *07:14, *07:16
C*07:07 ~ *07:11, *07:13, *07:15, *07:17 ~ *07:29

C*08

Cw8 세로타입:C*08:01, *08:02 및 *08:03
C*08:05 ~ *08:12

다른이들

C*12:02 ~ *12:15
C*14:02 ~ *14:05
C*15:01 ~ *15:11
C*16:01 ~ *16:06
C*17:01 ~ *17:03
C*18:01 및 *18:02

공통하플로타입

Cw4-B35(서아프리카에서 아메리카 원주민으로) Cw7-B7(서아프리카, 남아공) Cw7-B8(서아프리카) Cw1-B46(중국, 인도차이나) Cw5-B44(서아프리카)

상호작용

HLA-C는 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

KIR2DL1,^[5]^[6]^[7]^[8]
릴라3^[9]
백혈구 면역글로불린 유사 수용체 계열, 특히 활성 수용체 LILRA1

참조

^ ^a ^b ^c ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000204525, ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 - Ensembl, May 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Ríos A, Rodríguez JM, Moya MR, Galindo PJ, Canteras M, Alvarez MR, Parrilla P (2006). "Associations of HLA-C alleles with multinodular goiters: study in a population from southeastern Spain". Arch Surg. 141 (2): 123–8. doi:10.1001/archsurg.141.2.123. PMID 16490887.
^ Montes-Ares O, Moya-Quiles MR, Montes-Casado M, Guerra-Pérez N, Campillo JA, González C, López-Bermejo A, Tamayo M, Majado MJ, Parrado A, Muro M, Marín L, Alvarez-López MR (2006). "Human leucocyte antigen-C in B chronic lymphocytic leukaemia". Br J Haematol. 135 (4): 517–9. doi:10.1111/j.1365-2141.2006.06334.x. PMID 17054674. S2CID 23018830.
^ Boyson JE, Erskine R, Whitman MC, Chiu M, Lau JM, Koopman LA, Valter MM, Angelisova P, Horejsi V, Strominger JL (December 2002). "Disulfide bond-mediated dimerization of HLA-G on the cell surface". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (25): 16180–5. Bibcode:2002PNAS...9916180B. doi:10.1073/pnas.212643199. PMC 138585. PMID 12454284.
^ Baba E, Erskine R, Boyson JE, Cohen GB, Davis DM, Malik P, Mandelboim O, Reyburn HT, Strominger JL (December 2000). "N-linked carbohydrate on human leukocyte antigen-C and recognition by natural killer cell inhibitory receptors". Hum. Immunol. 61 (12): 1202–18. doi:10.1016/s0198-8859(00)00184-1. PMID 11163076.
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^ Jones DC, Kosmoliaptsis V, Apps R, Lapaque N, Smith I, Kono A, Chang C, Boyle LH, Taylor CJ, Trowsdale J, Allen RL (March 2011). "HLA class I allelic sequence and conformation regulate leukocyte Ig-like receptor binding". J. Immunol. 186 (5): 2990–7. doi:10.4049/jimmunol.1003078. PMID 21270408.

추가 읽기

Geyer M, Fackler OT, Peterlin BM (2001). "Structure--function relationships in HIV-1 Nef". EMBO Rep. 2 (7): 580–5. doi:10.1093/embo-reports/kve141. PMC 1083955. PMID 11463741.
Greenway AL, Holloway G, McPhee DA, Ellis P, Cornall A, Lidman M (2004). "HIV-1 Nef control of cell signalling molecules: multiple strategies to promote virus replication". J. Biosci. 28 (3): 323–35. doi:10.1007/BF02970151. PMID 12734410. S2CID 33749514.
Bénichou S, Benmerah A (2003). "[The HIV nef and the Kaposi-sarcoma-associated virus K3/K5 proteins: "parasites"of the endocytosis pathway]". Med Sci (Paris). 19 (1): 100–6. doi:10.1051/medsci/2003191100. PMID 12836198.
Leavitt SA, SchOn A, Klein JC, Manjappara U, Chaiken IM, Freire E (2004). "Interactions of HIV-1 proteins gp120 and Nef with cellular partners define a novel allosteric paradigm". Curr. Protein Pept. Sci. 5 (1): 1–8. doi:10.2174/1389203043486955. PMID 14965316.
Tolstrup M, Ostergaard L, Laursen AL, Pedersen SF, Duch M (2004). "HIV/SIV escape from immune surveillance: focus on Nef". Curr. HIV Res. 2 (2): 141–51. doi:10.2174/1570162043484924. PMID 15078178.
Joseph AM, Kumar M, Mitra D (2005). "Nef: "necessary and enforcing factor" in HIV infection". Curr. HIV Res. 3 (1): 87–94. doi:10.2174/1570162052773013. PMID 15638726.
Anderson JL, Hope TJ (2005). "HIV accessory proteins and surviving the host cell". Current HIV/AIDS Reports. 1 (1): 47–53. doi:10.1007/s11904-004-0007-x. PMID 16091223. S2CID 34731265.

외부 링크

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000204525, ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 - Ensembl, May 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] Ríos A, Rodríguez JM, Moya MR, Galindo PJ, Canteras M, Alvarez MR, Parrilla P (2006). "Associations of HLA-C alleles with multinodular goiters: study in a population from southeastern Spain". Arch Surg. 141 (2): 123–8. doi:10.1001/archsurg.141.2.123. PMID 16490887.

[4] Montes-Ares O, Moya-Quiles MR, Montes-Casado M, Guerra-Pérez N, Campillo JA, González C, López-Bermejo A, Tamayo M, Majado MJ, Parrado A, Muro M, Marín L, Alvarez-López MR (2006). "Human leucocyte antigen-C in B chronic lymphocytic leukaemia". Br J Haematol. 135 (4): 517–9. doi:10.1111/j.1365-2141.2006.06334.x. PMID 17054674. S2CID 23018830.

[pmid12454284-5] Boyson JE, Erskine R, Whitman MC, Chiu M, Lau JM, Koopman LA, Valter MM, Angelisova P, Horejsi V, Strominger JL (December 2002). "Disulfide bond-mediated dimerization of HLA-G on the cell surface". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (25): 16180–5. Bibcode:2002PNAS...9916180B. doi:10.1073/pnas.212643199. PMC 138585. PMID 12454284.

[pmid11163076-6] Baba E, Erskine R, Boyson JE, Cohen GB, Davis DM, Malik P, Mandelboim O, Reyburn HT, Strominger JL (December 2000). "N-linked carbohydrate on human leukocyte antigen-C and recognition by natural killer cell inhibitory receptors". Hum. Immunol. 61 (12): 1202–18. doi:10.1016/s0198-8859(00)00184-1. PMID 11163076.

[pmid9768753-7] Valés-Gómez M, Reyburn HT, Mandelboim M, Strominger JL (September 1998). "Kinetics of interaction of HLA-C ligands with natural killer cell inhibitory receptors". Immunity. 9 (3): 337–44. doi:10.1016/s1074-7613(00)80616-0. PMID 9768753.

[pmid11323700-8] Fan QR, Long EO, Wiley DC (May 2001). "Crystal structure of the human natural killer cell inhibitory receptor KIR2DL1-HLA-Cw4 complex". Nat. Immunol. 2 (5): 452–60. doi:10.1038/87766. PMID 11323700. S2CID 24707532.

[pmid21270408-9] Jones DC, Kosmoliaptsis V, Apps R, Lapaque N, Smith I, Kono A, Chang C, Boyle LH, Taylor CJ, Trowsdale J, Allen RL (March 2011). "HLA class I allelic sequence and conformation regulate leukocyte Ig-like receptor binding". J. Immunol. 186 (5): 2990–7. doi:10.4049/jimmunol.1003078. PMID 21270408.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

v t 주요 조직 적합성 복합 클래스
MHC 클래스 I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC 클래스 II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
기타	인간 백혈구 항원 소조직적합성항원 수혈 아레스틴 칼그라눌린 인간혈액군계 세포접착분자 분화 클러스터

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