| 项目 | 语言 | 说明 |
|---|---|---|
| fq-compressor | C++23 | FASTQ 专用压缩归档：列式分离 + 2-bit 碱基打包 + Zstd，三层 XXH64 校验，内存有界 |
| fq-compressor-rust | Rust | 围绕块索引 .fqc 归档格式的独立实现，支持随机访问 |
⚠️ 两个fqc的格式族不同。 它们共享fqc命令名与.fqc后缀，但归档格式族互不兼容，不能互相解码。跨实现使用前请先确认格式族，详见各仓库 README。 两者的许可证也不同，详见各自LICENSE。
| 项目 | 语言 | 说明 |
|---|---|---|
| fastq-tools | C++23 | 高性能 FASTQ 质控工具（统计 / 过滤）：零拷贝 I/O、TBB 流水线 |
| minibwa-rust | Rust | 内存安全的 BWA-MEM 风格单端 DNA 短读比对器，以 C 参考实现为行为标准 |
| bwa-rust | Rust | BWA-MEM 风格单端短读比对：FM-index、SMEM 种子、chaining、Smith-Waterman、SAM 输出 |
| 项目 | 语言 | 说明 |
|---|---|---|
| micos-2024 | Python | 2024「猛犸杯」参赛作品 · 宏基因组学端到端分析流程 |
| 项目 | 说明 |
|---|---|
| wiki-bioinfo | 面向中文社区的生物信息学体系化知识库：连接生物学对象、计算模型、核心算法、分析流程与数据资源 |
| awesome-bioinfo-algorithms | 精选生物信息学算法知识库，含复杂度分析、CLI 维护工具与双语文档 |