MT-ND3

MT-ND3
ND3
식별자
에일리어스ND3, MTMT-NADH탈수소효소, 서브유닛3(복합체I), NADH탈수소효소 서브유닛3
외부 IDOMIM: 516002 MGI: 102499 HomoloGene: 5018 GeneCard: ND3
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

없음

없음

RefSeq(단백질)

없음

NP_904335

장소(UCSC)Chr M: 0.01 ~ 0.01 MbChr M: 0.01 ~ 0.01 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집
인간 미토콘드리아 게놈에서 MT-ND3 유전자의 위치.MT-ND3는 7개의 NADH 탈수소효소 미토콘드리아 유전자(노란색 상자) 중 하나이다.

MT-ND3NADH 탈수소효소 3([5]ND3) 단백질을 코드하는 미토콘드리아 게놈의 유전자이다.ND3 단백질은 NADH 탈수소효소(유비퀴논)의 서브유닛으로 미토콘드리아 내막에 위치하며 전자전달계[6]5가지 복합체 중 가장 크다.MT-ND3의 변종들은 미토콘드리아 뇌근증, 젖산증, 뇌졸중 유사 증상(MELAS), 리 증후군(LS), 리버 유전성 시신경증(LHON)[7][8]과 관련이 있다.

구조.

일반적인 기능

MT-ND3는 염기쌍 10,059에서 10,404까지의 [5]인간 미토콘드리아 DNA에 위치한다.MT-ND3 유전자는 115개의 [9][10]아미노산으로 구성된 13kDa 단백질을 생성한다.MT-ND3는 NADH 탈수소효소(유비퀴논)의 서브유닛을 코드하는 7개의 미토콘드리아 유전자 중 하나로, MT-ND1, MT-ND2, MT-ND4, MT-ND5MT-ND6과 함께 복합체 I으로도 알려진 가장 크다.이 구조는 알려진 모든 산화환원센터와 NADH 결합 부위를 포함하는 말초 암에 대한 긴 소수성 트랜스막 도메인과 친수성 도메인을 가진 L자형이다.MT-ND3 생성물과 나머지 미토콘드리아 부호화 서브유닛은 복합체 I의 서브유닛 중 가장 소수성이며 막 통과 [6]영역의 핵심을 형성한다.

미번역 추가 뉴클레오티드

많은 종의 새와 거북이의 MT-ND3 유전자에는 [12]단백질로 변환되지 않는 여분의 뉴클레오티드가 있습니다.번역 프레임 쉬프트 또는 RNA 편집은 1뉴클레오티드 삽입을 가진 조류에서 ND3 판독 프레임의 기능성을 유지하기 위한 대체 설명입니다.이러한 추가적인 뉴클레오티드의 특징은 분자 계통학 [13][14]연구에서 입증되었듯이 거북이가 Archosauria와 관련이 있을 수 있다는 것을 암시합니다.악어와 몇몇 새와 거북이에게 여분의 뉴클레오티드가 없다는 것은 또한 대응하는 분류군이 이 특징을 잃었다는 것을 나타낼 수 있다.

기능.

MT-ND3 제품은 NADH 탈수소 및 유비퀴논으로의 전자 전달을 촉매하는 데 필요한 핵심 단백질의 최소 조합에 속하는 것으로 여겨지는 호흡 사슬 복합체 I의 하위 단위이다(코엔자임 Q10).[15]처음에 NADH는 복합 I에 결합하고 두 개의 전자를 플라빈 모노뉴클레오티드(FMN) 보철암의 이소알록사진 고리로 전달하여 FMNH를2 형성한다. 전자는 보철 암의 일련의 철-황(Fe-S) 클러스터를 통해 전달되고 최종적으로 코엔자임 Q10으로 환원된다.전자의 흐름은 단백질의 산화환원 상태를 변화시켜 이온화 측쇄의 구조 변화와 pK 이동을 유발하며, 이는 미토콘드리아 [6]매트릭스에서 4개의 수소 이온을 내보낸다.

임상적 의의

MT-ATP6, MT-TL1, MT-TK, MT-TW, MT-TV, MT-ND1, MT-ND2, MT-5ND-4의 변종과 마찬가지로 미토콘드리아 유전자 MT-ND3의 병원성 변종이 mtDNA 관련 Leigh 증후군을 일으키는 것으로 알려져 있다.미토콘드리아 에너지 생성의 이상은 생후 12개월에서 3년 사이에 증상이 나타나는 리 증후군과 같은 신경변성 장애를 일으킨다.바이러스 감염 후 증상이 자주 나타나며 운동장애와 말초신경장애, 저혈압, 경련, 소뇌실조증 등이 있다.영향을 받는 환자의 약 절반이 3살까지 호흡부전이나 심부전으로 사망한다.리증후군은 모계 유전 질환으로 앞서 언급한 MT-ND3를 [7]포함한 미토콘드리아 유전자의 유전자 검사를 통해 진단이 확립된다.이러한 복합 I 유전자는 레버의 유전성 시신경증(LHON), 뇌졸중 유사 증세를 동반하는 미토콘드리아 뇌근증(MELAS), 그리고 앞서 언급한 리 [8]증후군포함한 다양한 신경 퇴행성 질환과 연관되어 있다.

상호 작용

MT-ND3는 2개의 co-complex 상호작용을 포함하여 5개의 단백질-단백질 상호작용을 가진 것으로 나타났다.MT-ND3는 APP 및 NDUFA9[16]상호 작용하는 것으로 보입니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000198840 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000064360 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: MT-ND3 NADH dehydrogenase subunit 3".
  6. ^ a b c Donald Voet; Judith G. Voet; Charlotte W. Pratt (2013). "18". Fundamentals of biochemistry : life at the molecular level (4th ed.). Hoboken, NJ: Wiley. pp. 581–620. ISBN 9780470547847.
  7. ^ a b Thorburn DR, Rahman S (1993–2015). "Mitochondrial DNA-Associated Leigh Syndrome and NARP". In Pagon RA, Adam MP, Ardinger HH, Wallace SE, Amemiya A, Bean LJ, Bird TD, Dolan CR, Fong CT, Smith RJ, Stephens K (eds.). GeneReviews [Internet]. Seattle (WA): University of Washington, Seattle.
  8. ^ a b La Morgia C, Caporali L, Gandini F, Olivieri A, Toni F, Nassetti S, Brunetto D, Stipa C, Scaduto C, Parmeggiani A, Tonon C, Lodi R, Torroni A, Carelli V (May 2014). "Association of the mtDNA m.4171C>A/MT-ND1 mutation with both optic neuropathy and bilateral brainstem lesions". BMC Neurology. 14: 116. doi:10.1186/1471-2377-14-116. PMC 4047257. PMID 24884847.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (October 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
  10. ^ "NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB).
  11. ^ "Complete mitochondrial genome sequences". megasun.bch.umontreal.ca. Retrieved 2017-02-20.
  12. ^ Mindell DP, Sorenson MD, Dimcheff DE (November 1998). "An extra nucleotide is not translated in mitochondrial ND3 of some birds and turtles". Molecular Biology and Evolution. 15 (11): 1568–71. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025884. PMID 12572620.
  13. ^ Chiari Y, Cahais V, Galtier N, Delsuc F (July 2012). "Phylogenomic analyses support the position of turtles as the sister group of birds and crocodiles (Archosauria)". BMC Biology. 10: 65. doi:10.1186/1741-7007-10-65. PMC 3473239. PMID 22839781.
  14. ^ Crawford NG, Faircloth BC, McCormack JE, Brumfield RT, Winker K, Glenn TC (October 2012). "More than 1000 ultraconserved elements provide evidence that turtles are the sister group of archosaurs". Biology Letters. 8 (5): 783–6. doi:10.1098/rsbl.2012.0331. PMC 3440978. PMID 22593086.
  15. ^ "MT-ND3 - NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 - Homo sapiens (Human)". UniProt.org: a hub for protein information. The UniProt Consortium.
  16. ^ "5 binary interactions found for search term MT-ND3". IntAct Molecular Interaction Database. EMBL-EBI. Retrieved 2018-08-25.

추가 정보

외부 링크