Pyhäjärvi on vahvoilla maanalaisen eurooppalaisen tutkimuskeskuksen sijoituspaikaksi. Tällä hetkellä Pyhäsalmen kaivoksessa on käynnissä EU:n rahoittama LAGUNA-tutkimushanke, jossa selvitetään voidaanko syvälle maan alle rakentaa iso laboratorio.
Varsinaiseksi LAGUNA-tutkimuskeskuksen paikaksi on ehdolla seitsemän mahdollista sijoituspaikkaa Euroopassa, joista Pyhäjärvi on yksi. Vertailututkimuksessa selvitetään kolmen eri ilmaisimen ja sijoituspaikkojen soveltuvuutta toimintaan.
Pyhäjärvellä tutkitaan parhaillaan muun muassa tutkimuskeskuksen kustannuksia, aikataulua ja ympäristövaikutuksia. Vuoden kuluttua valmistuva raportti lähtetään rahoitusorganisaatioille.
Pyhäjärven hankkeen kustannusarvio on noin 500 miljoonaa euroa, josta infrasruktuurin rakentamiseen uppoaisi 100 miljoonaa euroa. Päätöksiä hankkeesta saadaan aikaisintaan vuonna 2011 tai 2012.
Laboratoriossa olisi tarkoitus mitata muun muassa avaruudesta tulevia hiukkasia, kosmista säteilyä ja etsiä aineen harvinaisempia hajoamismuotoja.